İçeriğe geç

Lipk

LIPK geni, enzimlerin lipaz ailesine ait bir protein olan Lipaz Üyesi K’yi kodlar. Lipazlar, lipitlerdeki ester bağlarının hidrolizini katalize eden ve lipit metabolizmasında kritik bir rol oynayan temel enzimlerdir. LIPK spesifik olarak bir lizozomal asit lipazı olarak kategorize edilir. Lizozomlar, kompleks lipitler de dahil olmak üzere atık maddelerin ve hücresel döküntülerin parçalanmasından sorumlu hücresel organellerdir. Bir lizozomal lipaz olarak, LIPK bu kompartmanlar içinde çeşitli lipitlerin degradasyonu ve geri dönüşümünde rol oynar; bu da hücresel homeostazın ve uygun lipit dengesinin korunması için hayati öneme sahiptir.

Lizozomal lipid metabolizmasındaki temel rolü göz önüne alındığında, LIPK çeşitli fizyolojik ve patolojik süreçlerde rol oynamaktadır. Lizozomal lipaz aktivitesinin düzensizliği, hücre içinde parçalanmamış lipidlerin birikimine yol açarak lizozomal depolama hastalıklarına katkıda bulunur. Bu nadir durumların ötesinde, LIPK’daki varyasyonlar, ateroskleroz, metabolik sendrom ve enflamatuar durumlar gibi değişmiş lipid metabolizmasını içeren daha yaygın çok faktörlü hastalıklara bir bireyin yatkınlığını etkileyebilir.LIPK’daki genetik varyantların işlevini veya ekspresyonunu nasıl etkilediğini anlamak, hastalık mekanizmaları ve potansiyel risk faktörleri hakkında bilgi sağlayabilir.

LIPK gibi genlerin incelenmesi, insan biyolojisi ve sağlığına ilişkin geniş çaplı anlayışımıza önemli ölçüde katkıda bulunur. LIPK’nın işlevi ve genetik varyasyonlarının etkisi hakkındaki bilgi; hastalık tanısı için yeni biyobelirteçlerin belirlenmesine, hastalık riskinin tahmin edilmesine ve lipidle ilişkili bozukluklar için hedefe yönelik tedavi stratejileri geliştirilmesine yardımcı olabilir. Bu araştırma, tıbbi tedavileri her hastanın genetik yapısına dayanarak bireysel özelliklerine göre uyarlamayı amaçlayan kişiselleştirilmiş tıp hedefleriyle uyumludur.

Çalışma Tasarımı ve İstatistiksel Güçteki Zorluklar

Section titled “Çalışma Tasarımı ve İstatistiksel Güçteki Zorluklar”

Büyük ölçekli genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) ve meta-analizler, lipid seviyelerini etkileyen çok sayıda genetik varyantı tanımlamış olsa da, çalışma tasarımında ve istatistiksel güçte doğal sınırlamalar devam etmektedir.[1] On binlerce bireyden gelen verilerin birleştirilmesine rağmen, katkıda bulunan tüm varyantları tespit etme istatistiksel gücü eksik kalmaktadır, özellikle daha küçük etki büyüklüklerine veya daha düşük frekanslara sahip olanlar için.[1] Bulguları doğrulamak için kritik olan replikasyon çabaları, farklı popülasyonlar arasındaki bağlantı dengesizliği (LD) örüntülerindeki farklılıklar tarafından da engellenebilir; bu durum, Avrupalı Beyaz ve Hint Asyalı kohortları arasında gözlemlendiği gibi, tutarsız replikasyon sinyallerine yol açar.[2] Ayrıca, birçok analizde aditif genetik modele dayanılması, yani özelliklerin her ek allel ile eşit miktarlarda değişip değişmediğini test etmesi, daha karmaşık genetik mimarileri veya etkileşim etkilerini gözden kaçırabilir.[3] Diğer bir sınırlama, veri kalitesi ve analitik varsayımlarla ilgilidir. Bazı çalışmalar, belirli popülasyonlar için yüksek kaliteli imputasyon eksikliği olduğunu belirtmiş, potansiyel olarak genetik varyasyonun kapsamlı değerlendirmesini etkilemiştir.[2] Dahası, popülasyon tabakalanmasını azaltmak için genomik kontrol düzeltmeleri uygulanırken, farklı araştırmalar arasındaki meta-analizlerdeki heterojenite, kabul edilmiş bir zorluk olmaya devam etmektedir; bu durum, birleştirilmiş kohortlar arasında etki tahminlerinde veya altta yatan genetik faktörlerde potansiyel değişkenlik olduğunu ima etmektedir.[4] Bu faktörler, büyük örneklem boyutlarına rağmen bile, ince yanlılıkların veya metodolojik farklılıkların genetik bulguların yorumunu ve eksiksizliğini etkileyebileceğini vurgulamaktadır.

Genellenebilirlik ve Fenotipik Heterojenite

Section titled “Genellenebilirlik ve Fenotipik Heterojenite”

Bulguların genellenebilirliği önemli bir husustur, zira birçok keşif ve replikasyon kohortu ağırlıklı olarak Avrupa kökenli bireylerden oluşmaktadır.[1] Bazı çalışmalar bulguları Singapurlu Çinli, Malay ve Asyalı Hintliler gibi çok etnikli örneklere genişletme çabalarını içerse veya kurucu etkileri olan Kosrae popülasyonu gibi spesifik genetik izolatları kapsasa da, bu genetik ilişkilendirmelerin tüm küresel popülasyonlara ne ölçüde yayıldığı daha fazla araştırma gerektirmektedir.[4] Farklı kökenlerdeki belirgin genetik arka planlar ve çevresel maruziyetler, tek bir baskın kökene odaklanan çalışmalar tarafından tam olarak yakalanamayan değişen allel frekanslarına, LD paternlerine veya gen-çevre etkileşimlerine yol açabilir.

Fenotipik ölçüm ve tanımlamalar da değişkenlik yaratır. Çalışma popülasyonlarının demografik yapısındaki farklılıklar, lipid veya karaciğer enzim seviyeleri için deney tekniklerindeki metodolojik varyasyonlarla birleştiğinde, kohortlar arasında ortalama özellik seviyelerinde tutarsızlıklara yol açabilir.[2] Araştırmacılar genellikle yaş ve cinsiyet gibi kovaryatları düzeltse ve lipid düşürücü tedaviler kullanan bireyleri dışlasa da, kalıntı karıştırıcılık veya fenotip saptamasındaki ince farklılıklar yine de ilişkilendirme sinyallerinin karşılaştırılabilirliğini ve tutarlılığını etkileyebilir.[1] Bazı özellikler için, normal olmayan dağılım veya saptanabilir limitlerin altındaki seviyeler gibi sorunlar veri dönüşümlerini veya dikotomizasyonu gerektirmiştir; bu da istatistiksel gücü ve genetik etkilerin kesin tahminini etkileyebilir.[3]

Açıklanamayan Kalıtım ve Nedensel Mekanizmalar

Section titled “Açıklanamayan Kalıtım ve Nedensel Mekanizmalar”

Lipid düzeyleriyle ilişkili çok sayıda lokusun keşfedilmesine rağmen, tanımlanan genetik varyantlar, bu özellikler için gözlemlenen kalıtımın yalnızca mütevazı bir kısmını, genellikle toplam değişkenliğin %5 ila %8’i arasında değişen bir oranını topluca açıklamaktadır.[1] Bu önemli “eksik kalıtım”, dislipidemiye katkıda bulunan birçok genetik faktörün henüz keşfedilmediğini düşündürmektedir. Potansiyel açıklamalar arasında her biri son derece küçük etkilere sahip çok sayıda yaygın varyant, mevcut SNP dizileri tarafından yeterince yakalanamayan daha büyük etkilere sahip nadir genetik varyantlar veya genler (GENENAME) ile çevre arasındaki karmaşık etkileşimler bulunmaktadır.[5] Mevcut ilişkilendirme yaklaşımları öncelikli olarak yaygın varyantları tespit etmek üzere tasarlanmıştır ve kalıtımın daha büyük bir kısmını açıklayabilecek nadir, yüksek etkili varyantların katkısını gözden kaçırabilir.

Ayrıca, GWAS’tan tanımlanan çoğu tek nükleotid polimorfizmi (SNP), gerçek altta yatan nedensel varyantlar için vekil görevi görür ve doğrudan işlevsel değildir.[4] Bu durum, bir bölgenin ilişkili olduğu durumlarda bile, kesin işlevsel varyantın ve etkilediği spesifik genin (GENENAME) genellikle hemen net olmadığını, özellikle birden fazla aday genin bulunduğu bölgelerde bu durumun geçerli olduğunu göstermektedir.[5] Bu nedenle, bu ilişkili lokusların lipid metabolizmasını hangi kesin moleküler mekanizmalar aracılığıyla etkilediğine dair kritik bir bilgi boşluğu devam etmektedir. Geniş kohortlarda ekzonların ve korunmuş düzenleyici bölgelerin hedeflenmiş yeniden dizilenmesi gibi gelecek çabalar, bu işlevsel varyantları tam olarak belirlemek ve bunların lipid düzenlemesi ve ilişkili hastalıklardaki biyolojik rollerini tamamen aydınlatmak için hayati öneme sahiptir.[5]

_CFH_ geni veya Kompleman Faktör H, doğuştan gelen bağışıklık yanıtının hayati bir parçası olan kompleman sisteminin düzenlenmesinde kritik bir rol oynar. Birincil işlevi, kendi yüzeylerinde alternatif kompleman yolunun aktivasyonunu inhibe ederek konakçı hücreleri kompleman aracılı hasardan korumak ve aynı zamanda patojenler üzerindeki aktivitesine izin vermektir.[6] Bu düzenleyici eylem, immün homeostazı sürdürmek ve kronik enflamasyonu önlemek için esastır; bu durum, metabolik sağlık ve lipid profilleri de dahil olmak üzere çeşitli fizyolojik süreçler için geniş kapsamlı sonuçlar doğurabilir.[6]Tek nükleotid polimorfizmi (SNP)*rs10922098 *, _CFH_ geninde yer almakta olup, genin işlevini veya ifadesini etkileyebilecek genetik bir varyasyonu temsil etmektedir. _CFH_’deki varyantlar, değişmiş Kompleman Faktör H protein yapısına veya miktarına yol açarak, potansiyel olarak kompleman kaskadını düzgün bir şekilde düzenleme yeteneğini etkileyebilir.[6] Bu tür değişiklikler, aşırı aktif veya az aktif bir kompleman sistemi ile sonuçlanabilir; her ikisi de metabolik yollar ve çeşitli metabolitlerin işlenmesi dahil olmak üzere sistemik sağlığı etkileyen inflamatuar durumlara ve doku hasarına katkıda bulunabilir.[6] *rs10922098 * ve _CFH_ işlevinin etkileri, lipid metabolizması alanına kadar uzanır ve lipase member k gibi enzimlerin aktivitesiyle çakışabilir. _CFH_’nin lipoproteinler de dahil olmak üzere çeşitli bileşenlerle etkileşime girdiği gösterilmiştir ve kompleman sisteminin düzensizliği, vücudun lipidleri nasıl işlediğini etkileyen inflamatuar süreçlere katkıda bulunabilir.[6] Lipazlar, dolaşımdaki lipidlerin parçalanması ve yeniden şekillendirilmesi için çok önemlidir ve işlevleri inflamatuar ortamdan etkilenebilir. Bu nedenle, _CFH_ aktivitesini modüle eden *rs10922098 * gibi bir varyant, sistemik enflamasyonu değiştirerek veya lipid partikülleriyle doğrudan etkileşime girerek lipase member k’yı dolaylı olarak etkileyebilir, nihayetinde genel lipid profilini ve ilişkili özellikleri etkileyebilir.[6]

RS IDGenİlişkili Özellikler
rs10922098 CFHprotein measurement
blood protein amount
uromodulin measurement
probable G-protein coupled receptor 135 measurement
g-protein coupled receptor 26 measurement

Lipazların Tanımsal Çerçevesi ve Metabolik Önemleri

Section titled “Lipazların Tanımsal Çerçevesi ve Metabolik Önemleri”

Lipaz k üyesi, biyolojik sistemler içinde yağların parçalanması ve sentezinde temel bir rol oynayarak lipid metabolizması için hayati öneme sahip olan geniş lipaz sınıfına ait bir enzimi temsil eder. Sunulan çalışmalar, protein ürünleri dolaşımdaki lipid seviyelerini önemli ölçüde etkileyen LIPC, LIPG ve LPL gibi bazı önemli lipaz genlerini vurgulamaktadır (.[7] ). Bu enzimler, aktiviteleri plazmadaki çeşitli lipid türlerinin konsantrasyonlarını doğrudan etkileyerek karmaşık metabolik yollar içinde işlev görür. Bu enzimlerin fonksiyonel önemini anlamak, lipid homeostazı ve disregülasyonunu kavramak için kilit niteliğindedir.

Bir lipaz üyesinin, “lipaz k üyesi” dahil olmak üzere, fonksiyonel tanımı, Glukozilfosfatidilinositol-spesifik fosfolipaz D (GPI-PLD) ile örneklenen, ilgili lipidleri modifiye eden enzimlere kadar uzanır (.[8] ). Bu tür enzimler, lipidlerdeki ester bağlarını hidrolize etme yetenekleriyle karakterize edilir ve bunların taşınmasını, depolanmasını ve kullanılmasını kolaylaştırır. Böyle bir enzimin operasyonel tanımı, genellikle plazma lipid konsantrasyonları gibi kantitatif özelliklerle genetik ilişkisini değerlendirmeyi içerir ve böylece genetik varyasyonu enzim fonksiyonu ve metabolik sonuçlara bağlayan kavramsal bir çerçeve oluşturur (.[7] ).

Lipid Fenotipleri Üzerindeki Sınıflandırma ve Etki

Section titled “Lipid Fenotipleri Üzerindeki Sınıflandırma ve Etki”

Lipaz üyeleri, öncelikle genetik lokuslarına ve popülasyon tabanlı genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) aracılığıyla tanımlanan çeşitli lipid fenotipleri üzerindeki kanıtlanmış etkilerine göre sınıflandırılır. LIPC, LIPG ve LPLgibi genler, serum yüksek yoğunluklu lipoprotein kolesterolünü (HDL), düşük yoğunluklu lipoprotein kolesterolünü (LDL) ve trigliseridleri etkileyerek poligenik dislipidemiye katkıda bulunan lokuslar olarak kabul edilir (.[7]). Bu sınıflandırma, ayrı hastalık birimleri yerine, lipidle ilişkili durumların bir spektrumunu tanımlamadaki rollerini vurgular. Bu çalışmalardaki sınıflandırma yaklaşımları, nicel özelliklerin boyutlu analizlerine yönelerek, birden fazla genetik ve çevresel faktörden etkilenen sürekli bir lipid düzeyi aralığını tanır.

Lipaz fonksiyonuyla ilişkili durumlar için şiddet derecelendirmeleri tipik olarak ortaya çıkan lipid profillerine uygulanır. Örneğin, dislipidemi, toplam kolesterol, LDL-kolesterol, HDL-kolesterol ve trigliserid düzeylerine göre sınıflandırılır (.[9]). Bu sınıflandırmalar, kardiyovasküler hastalık riski artmış bireyleri belirlemeye yardımcı olur. Lipaz aktivitesini etkileyen spesifik genetik varyantların tanımlanması, lipid bozukluklarının genetik mimarisini anlamak için bir nosolojik çerçeve sağlar.

Lipazlar ve onların fonksiyonel bağlamıyla ilişkili temel terminoloji şunları içerir: “lipit düzeyleri”, “kolesterol” (total, HDL, LDL) ve “trigliseritler”; bunlar lipaz aktivitesinden etkilenen doğrudan metabolik ürünler veya substratlardır (.[9]). “Dislipidemi” ve “koroner kalp hastalığı riski” gibi diğer ilişkili kavramlar, değişmiş lipaz fonksiyonunun ve buna bağlı lipit dengesizliklerinin klinik çıkarımlarını tanımlar (.[7] ). Belirli lipazların isimlendirilmesi, LIPC, LIPG ve LPL’de görüldüğü gibi gen sembolü kurallarına uyar ve bunların ilgili genetik kökenlerini belirtir.

Lipaz aktivitesinin etkisini değerlendirmeye yönelik tanısal ve ölçüm kriterleri, ağırlıklı olarak plazma lipit konsantrasyonlarının kantifikasyonuna dayanarak dolaylıdır. Standardize edilmiş yaklaşımlar, belirlenmiş normal aralıklar (Lp(a) için 0.1–6.5 mg/dl) ve klinik eşik değerleri (örneğin, yüksek Lp(a) düzeyleri için >14 mg/dl) ile Lp(a) proteini ve Lp(a) kolesterolün ölçülmesini içerir (.[9]). Benzer şekilde, kılavuzlara göre LDL-kolesterol (60–129 mg/dl), HDL-kolesterol (40–80 mg/dl), total kolesterol (120–199 mg/dl) ve trigliseritler (30–149 mg/dl) için eşikler tanımlanmıştır (.[9] ). Genellikle yaş ve cinsiyet gibi kovaryatlar için ayarlanan bu biyobelirteç ölçümleri, metabolik sağlık ve riskin kritik göstergeleri olarak hizmet eder, lipaz aktivitesinin fonksiyonel sonuçları hakkında bilgi sağlar (.[3] ).

Lipazların Lipid Metabolizmasındaki Rolü

Section titled “Lipazların Lipid Metabolizmasındaki Rolü”

Lipazlar, yağların hidrolizini katalize eden, vücut genelinde lipidlerin sindiriminde, emiliminde ve metabolizmasında merkezi bir rol oynayan kritik enzimlerdir. Lipoprotein lipaz (LPL) gibi enzimler, vücutta depolanan ve kanda taşınan ana yağ formu olan dolaşımdaki trigliseritlerin katabolizması için özellikle hayati öneme sahiptir.[10] LPL, şilomikronlar ve çok düşük yoğunluklu lipoproteinler (VLDL’ler) içinde taşınan trigliseritler üzerinde etki göstererek, onları serbest yağ asitleri ve gliserole parçalar. Ortaya çıkan bu yağ asitleri daha sonra kas ve yağ dokusu gibi çeşitli dokular tarafından enerji üretimi veya depolama için kolayca alınır, plazma trigliserit seviyelerini doğrudan etkileyerek kardiyovasküler sağlığı etkiler.[10] LPL’nin aktivitesi çeşitli faktörler tarafından sıkı bir şekilde düzenlenir; örneğin, angiopoietin-like protein 4 (ANGPTL4), LPL’yi güçlü bir şekilde inhibe edebilir, böylece kan dolaşımından trigliserit temizliğini etkileyerek potansiyel olarak hiperlipidemiye katkıda bulunur.[11]

Bir bireyin lipid profili, çok sayıda genin lipid homeostazisinin karmaşık dengesini etkilemesiyle genetik yapısı tarafından önemli ölçüde şekillendirilir. LPL gibi genlerin yakınındaki ve APOA5-APOA4-APOC3-APOA1gen kümesi içindeki yaygın genetik varyasyonlar, trigliserit ve yüksek yoğunluklu lipoprotein kolesterol (HDL-C) plazma konsantrasyonları ile güçlü bir şekilde ilişkilidir.[10] Özellikle, APOA5’teki polimorfizmlerin trigliserit seviyelerini etkilediği ve lipid özelliklerinin genetik temelini vurguladığı bilinmektedir.[10] Lipazların doğrudan etkisinin ötesinde, kolesterol sentezi için gerekli olan HMGCR(3-hidroksi-3-metilglutaril koenzim A redüktaz) gibi genler ve düşük yoğunluklu lipoprotein reseptörü (LDLR) proteininin bir düzenleyicisi olan PCSK9(proprotein konvertaz subtilisin/kexin tip 9), düşük yoğunluklu lipoprotein kolesterol (LDL-C) seviyelerini etkileyen genetik varyantlara sahiptir.[4]Tek nükleotid polimorfizmleri (SNP’ler) ve alternatif ekleme olayları dahil bu genetik faktörler, dolaşımdaki lipid seviyelerinde gözlemlenen kalıtsallığın önemli bir kısmını toplu olarak açıklamaktadır.[4] Ayrıca, düzenleyici elementler ve gen ifade paternleri, lipid metabolizmasını modüle etmede kritik bir rol oynamaktadır. Örneğin, FADS1-FADS2 gen kümesi, yağ asitlerine çift bağlar ekleyerek fosfolipitlerin ve diğer kompleks lipitlerin bileşimini etkileyen enzimler olan yağ asidi desatürazlarını kodlar.[10] Ek olarak, genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), transkripsiyonel bir düzenleyici olan MLXIPL (MLX etkileşimli protein benzeri) gibi genlerin plazma trigliserit seviyeleriyle önemli ölçüde ilişkili olduğunu tanımlamıştır.[12] Bireysel genetik varyantlar genellikle yalnızca mütevazı etkiler sağlarken, bunların kümülatif etkisi çeşitli lipid özelliklerinde gözlemlenen bireyler arası farklılıkların önemli bir kısmını açıklamaktadır.[13]

Lipit metabolizması, karaciğerin merkezi bir merkez görevi gördüğü, farklı doku ve organlardaki hücresel fonksiyonların ve etkileşimlerin karmaşık bir etkileşimini içerir. Karaciğer, trigliseritleri dağıtım için VLDL’lere sentezler ve paketler ve kolesterol efllüksünü kısmen ABCG5 ve ABCG8gibi ATP-bağlayıcı kaset (ABC) taşıyıcıları aracılığıyla yönetir.[10]Bu taşıyıcılar, hem bağırsaktan hem de karaciğerden diyet kolesterolü ve diğer sterolleri uzaklaştırmak için hayati öneme sahip fonksiyonel bir kompleks oluşturur veABCG5’teki mutasyonlar nadir görülen monogenik bozukluk olan sitosterolemiye yol açabilir.[10]Lipoprotein parçacıklarının akıbeti, katabolik oranlarını ve genel plazma lipit düzeylerini etkileyen ApoCIII ve ApoE gibi ilişkili apolipoproteinleri tarafından da belirlenir.[14] Ayrıca, genetik varyasyonlar apolipoprotein(a) (Lp(a)) plazma konsantrasyonlarını etkileyerek, hepatik hücreler tarafından işlenmesini ve salgılanmasını etkiler.[3] Bu koordineli sistemik süreçler, genel lipit homeostazının sürdürülmesi için gerekli olan lipitlerin periferik dokulara verimli bir şekilde taşınmasını ve teslim edilmesini sağlar.

Lipid homeostazının hassas ayarlı mekanizmalarındaki aksaklıklar, kandaki lipid veya lipoproteinlerin anormal konsantrasyonları ile karakterize bir durum olan dislipidemi ile doğrudan ilişkili patofizyolojik süreçlerdir. Dislipidemi, kardiyovasküler hastalık için önemli bir risk faktörüdür.[10]Yüksek plazma trigliseritleri, düşük HDL-C ve yüksek LDL-C’nin hepsi, koroner arter hastalığı riskinin artmasında iyi bilinen etkenlerdir.[10] Bu lipid özelliklerini etkileyen genetik varyantlar, özellikle HMGCR, LDLR, PCSK9 gibi genleri ve APOA5 kümesinin bileşenlerini etkileyenler, dislipideminin karmaşık poligenik yapısına ve bir bireyin kalp rahatsızlıklarına yatkınlığına katkıda bulunur.[13] Bu genetik ve moleküler temellerin kapsamlı bir şekilde anlaşılması, daha yüksek risk altındaki bireyleri tanımlamak ve lipid dengesizliğinin sistemik sonuçlarını hafifletmek için hedefe yönelik tedavi stratejileri geliştirmek açısından hayati öneme sahiptir.

“Lipaz üyesi k” enzim grubu, özellikle lipoprotein lipaz (LPL) ve hepatik lipaz (LIPC)‘ı kapsayarak, dolaşımdaki lipitlerin katabolizması ve dinamik yeniden şekillenmesi için temeldir. LPL, çok düşük yoğunluklu lipoproteinler (VLDL) ve şilomikronlar içinde bulunan trigliseritleri hidrolize ederek kritik bir rol oynar ve böylece yağ asitlerinin çeşitli periferik dokular tarafından alımını kolaylaştırır. Özellikle, *rs10468017 * konumundaki minör T alleli, daha düşük _LIPC_ ekspresyonu ve sonuç olarak daha yüksek HDL kolesterol seviyeleri ile ilişkilidir.[1] Bu ilişkilendirmeler, bir bireyin belirli lipit profillerine yatkınlığını anlamada _LIPC_ varyantlarının tanısal faydasını vurgulamakta ve poligenik dislipideminin daha geniş kapsamlı anlaşılmasına katkıda bulunmaktadır.

_LIPC_gibi genlerdeki varyasyonlar, koroner kalp hastalığı dahil olmak üzere kardiyovasküler hastalıklar için bir bireyin risk değerlendirmesine içgörü sağlar._LIPC_varyantlarının, kardiyovasküler riskin önemli bir ters göstergesi olan HDL kolesterol üzerindeki etkisi, hastalık progresyonunu ve uzun vadeli sonuçları öngörmedeki prognostik değerlerini düşündürmektedir.[1]Her bir varyant mütevazı bir etki gösterebilse de, toplu olarak bu genetik belirteçler, olumsuz kardiyovasküler sonuçlar için daha yüksek risk taşıyan bireylerin belirlenmesine katkıda bulunur.[1] Bu genetik ilişkilendirmeleri anlamak, yüksek riskli bireyleri belirlemek ve geleneksel risk faktörlerinin ötesinde risk sınıflandırma modellerini iyileştirmek için çok önemlidir.

Lipid Yönetimine Kişiselleştirilmiş Yaklaşımlar

Section titled “Lipid Yönetimine Kişiselleştirilmiş Yaklaşımlar”

_LIPC_ ve diğer lipid ile ilişkili lokuslar üzerine yapılan çalışmaların sağladığı genetik öngörüler, dislipidemi yönetiminde daha kişiselleştirilmiş tıp yaklaşımlarına yol açmaktadır. _LIPC_ *rs10468017 * gibi varyantlar aracılığıyla belirli genetik yatkınlıkların belirlenmesi, tedavi seçimine rehberlik edebilir ve klinisyenlerin lipid düşürücü tedavileri bireyin genetik profiline göre daha etkili bir şekilde uyarlamasına olanak tanıyabilir.[1]Ayrıca, bu tür genetik bilgiler izleme stratejilerine rehberlik edebilir; istenmeyen lipid profillerine genetik olarak yatkın olanlar için daha erken müdahaleye veya daha yoğun takibe olanak tanıyabilir. Genomiğin klinik pratiğe bu entegrasyonu, kardiyovasküler hastalık için hedeflenmiş önleme stratejileri geliştirmek adına umut vaat etmektedir.

[1] Kathiresan, S., et al. “Common variants at 30 loci contribute to polygenic dyslipidemia.” Nat Genet, vol. 40, no. 2, 2008, pp. 189-97.

[2] Yuan, X. et al. “Population-based genome-wide association studies reveal six loci influencing plasma levels of liver enzymes.” Am J Hum Genet, vol. 83, no. 4, 2008, pp. 520-528.

[3] Melzer, D., et al. “A genome-wide association study identifies protein quantitative trait loci (pQTLs).” PLoS Genet, vol. 4, no. 5, 2008, e1000072.

[4] Burkhardt, R., et al. “Common SNPs in HMGCR in micronesians and whites associated with LDL-cholesterol levels affect alternative splicing of exon13.” Arterioscler Thromb Vasc Biol, vol. 28, no. 12, 2008, pp. 2095-2101.

[5] Willer, C. J., et al. “Newly identified loci that influence lipid concentrations and risk of coronary artery disease.”Nat Genet, vol. 40, no. 2, 2008, pp. 161-169.

[6] Gieger C, et al. Genetics meets metabolomics: a genome-wide association study of metabolite profiles in human serum. PLoS Genet. 2008;4(11):e1000282.

[7] Aulchenko, Y. S., et al. “Loci influencing lipid levels and coronary heart disease risk in 16 European population cohorts.”Nat Genet, vol. 40, no. 1, 2008, pp. 29-37.

[8] Chalasani, N., et al. “Glycosylphosphatidylinositol-specific phospholipase d in nonalcoholic Fatty liver disease: A preliminary study.”J. Clin. Endocrinol. Metab. 91 (2006): 2279–2285.

[9] Ober, C., et al. “Genome-wide association study of plasma lipoprotein(a) levels identifies multiple genes on chromosome 6q.”J Lipid Res, vol. 50, no. 1, Jan. 2009, pp. 147-156.

[10] Aulchenko, Y. S., et al. “Loci influencing lipid levels and coronary heart disease risk in 16 European population cohorts.”Nat Genet, vol. 41, no. 1, 2009, pp. 47-55. PMID: 19060911.

[11] Yoshida, K., et al. “Angiopoietin-like protein 4 is a potent hyperlipidemia-inducing factor in mice and inhibitor of lipoprotein lipase.”J. Lipid Res. 43 (2002): 1770–1772.

[12] Kooner, J. S., et al. “Genome-wide scan identifies variation in MLXIPL associated with plasma triglycerides.” Nat. Genet., vol. 40, 2008, pp. 149–151.

[13] Kathiresan, S., et al. “Common variants at 30 loci contribute to polygenic dyslipidemia.” Nat Genet, vol. 41, no. 1, 2009, pp. 56-65. PMID: 19060906.

[14] Aalto-Setala, K., et al. “Mechanism of hypertriglyceridemia in human apolipoprotein (apo) CIII transgenic mice. Diminished very low density lipoprotein fractional catabolic rate associated with increased apo CIII and reduced apo E on the particles.”J. Clin. Invest. 90 (1992): 1889–1900.