Neoplazm
Yaygın olarak tümör olarak bilinen bir neoplazm, hücrelerin gerekenden fazla büyümesi ve bölünmesi veya gerektiğinde ölmemesi sonucunda oluşan anormal bir doku kitlesidir. Bu kontrolsüz büyüme vücudun herhangi bir yerinde meydana gelebilir ve topluca genellikle kanser olarak adlandırılan geniş bir hastalık yelpazesine yol açar. Neoplazmlar iyi huylu (kanserli olmayan) veya kötü huylu (kanserli) olabilir; kötü huylu neoplazmlar çevre dokuları istila etme ve vücudun uzak bölgelerine yayılma potansiyeline sahiptir, bu sürece metastaz denir.
Neoplazm gelişiminin biyolojik temeli, hücrelerdeki genetik değişikliklere dayanır. Tek nükleotid polimorfizmleri (SNP’ler) dahil olmak üzere bu değişiklikler, hücre büyümesini, bölünmesini ve ölümünü kontrol eden genleri etkileyebilir. Araştırmalar, özellikle genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) aracılığıyla, çeşitli neoplazm türlerine yatkınlıkla ilişkili çok sayıda genetik lokus tanımlamıştır. Örneğin, endometrial kanser riskinin artmasıyla ilişkili yaygın varyantlar tanımlanmıştır[1]. Benzer şekilde, kromozom 6p21.3 üzerindeki HLA bölgesindeki ve diğer bölgelerdeki spesifik lokuslar nazofarenks karsinomu ile ilişkilendirilmiştir [2]. Foliküler lenfoma için GWAS, 6p21.32’de ve diğer yatkınlık lokuslarında allelik heterojeniteyi ortaya çıkarmıştır [3]. Genetik faktörler ayrıca intraduktal papiller müsinöz neoplazm gibi durumların maligniteye doğru ilerlemesindeki[4] ve üst aerodigestif sistem kanserlerindeki [5]rolleri açısından da araştırılmaktadır. Bu genetik bilgiler, neoplazm oluşumunda kalıtsal yatkınlıklar ve çevresel faktörler arasındaki karmaşık etkileşimi vurgulamaktadır.
Neoplazmları anlamanın klinik önemi derindir, çünkü bunlar büyük bir küresel sağlık sorununu temsil etmektedir. Genetik araştırmalar, tanı, prognoz ve tedavi stratejilerini geliştirmede kritik bir rol oynamaktadır. SNP çalışmaları aracılığıyla daha yüksek genetik riske sahip bireylerin belirlenmesi, daha erken teşhise ve daha hedefe yönelik önleyici tedbirlere yol açabilir. Halihazırda etkilenenler için, spesifik neoplazmlarının genetik yapısını anlamak, kişiselleştirilmiş tedavi planlarına bilgi sağlayabilir ve potansiyel olarak daha etkili tedavilere ve daha iyi sonuçlara yol açabilir.
Toplumsal bir bakış açısıyla, neoplazmlar dünya genelindeki halk sağlığı sistemleri ve bireyler üzerinde önemli bir yük oluşturmaktadır. SNP’lerin rolü dahil olmak üzere, bu hastalıkların genetik temellerine yönelik devam eden araştırmalar, yeni tanı araçları, önleme stratejileri ve tedaviler geliştirmek için hayati öneme sahiptir. Genomik tıptaki ilerlemeler, neoplazmlarla ilişkili insidans ve mortaliteyi azaltma umudu sunarak, nihayetinde milyonlarca insanın yaşam kalitesini iyileştirmektedir.
Sınırlamalar
Section titled “Sınırlamalar”Neoplazmın genetik mimarisini anlama konusunda önemli ilerlemeler kaydedilmiş olsa da, mevcut araştırma metodolojilerinin doğasında bulunan bazı sınırlamalar ve hastalığın karmaşık doğası dikkate alınmayı gerektirmektedir. Bu sınırlamalar, bulguların yorumlanması ve gelecekteki araştırmalara rehberlik edilmesi açısından büyük önem taşımaktadır.
Metodolojik ve İstatistiksel Hususlar
Section titled “Metodolojik ve İstatistiksel Hususlar”Genetik ilişkilendirme çalışmalarının istatistiksel gücü, özellikle daha nadir neoplazm alt tipleri veya ince genetik etkilere sahip olanlar incelenirken, genellikle örneklem büyüklükleri tarafından kısıtlanır[6].
“Genel” kontrolleri hariç tutanlar gibi özel çalışma tasarımları, kohorta özgü yanlılıklar ortaya çıkarabilir ve bu da sonuçların daha geniş uygulanabilirliğini sınırlayabilir .
Neoplazm, etiyoloji, ilerleme ve klinik sunum açısından önemli fenotipik heterojenite ile karakterize edilen geniş bir hastalık yelpazesini kapsar; bu durum genetik analizleri karmaşıklaştırır ometrial kanser veya üst aerodigestif sistem kanserleri, her biri benzersiz moleküler özelliklere sahiptir[6].
Karmaşık Etiyoloji ve Açıklanamayan Varyasyon
Section titled “Karmaşık Etiyoloji ve Açıklanamayan Varyasyon”Neoplazm gelişimi, çevresel ve yaşam tarzı faktörlerinin genetik yatkınlıklarla karmaşık bir etkileşim içinde olduğu, ancak bu etkileşimlerin güncel çalışmalarla henüz tam olarak aydınlatılamadığı çok faktörlü bir süreçtir[5].
Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) aracılığıyla çok sayıda yaygın genetik varyantın tanımlanmasına rağmen, birçok neoplazmın kalıtımının önemli bir kısmı açıklanamamış kalmaktadır; bu durum “kayıp kalıtım” olarak adlandırılır. Bu boşluk, geleneksel GWAS metodolojileriyle tutarlı bir şekilde yakalanamayan nadir varyantların, yapısal varyasyonların, epigenetik modifikasyonların veya karmaşık gen-gen (epistatik) etkileşimlerinin etkilerinden kaynaklanabilir. Bu tür genetik yatkınlık lokuslarının belirlenmesi, farklı popülasyonlardaki kanser riskini anlamak için çok önemlidir[7].
Pigmentasyonun ötesinde, immün yanıtları, gen regülasyonunu ve DNA onarım mekanizmalarını etkileyen genetik varyantlar da neoplazm gelişiminde kritik öneme sahiptir.IRF4 (Interferon Düzenleyici Faktör 4), rs12203592 varyantının bulunduğu bir transkripsiyon faktörüdür ve B ve T lenfositleri dahil olmak üzere immün hücrelerin gelişimi ve işlevi için esastır. IRF4 aktivitesinin bozulması, foliküler lenfoma gibi lenfoproliferatif bozukluklara katkıda bulunabilir ve varyantları, pleiotropik etkilerini vurgulayarak melanom riskiyle ilişkilendirilmiştir. LINC03090 ve onun rs189122415 varyantı gibi uzun intergenik kodlamayan RNA’lar (lincRNA’lar), gen ekspresyonunun önemli düzenleyicileri olarak ortaya çıkmaktadır ve değişen aktiviteleri sıklıkla kanser süreçlerinde rol oynayarak hücre proliferasyonunu, farklılaşmasını ve metastazı etkilemektedir. Dahası,rs189086286 varyantını içeren FANCD2P2 gibi psödogenler, Fanconi Anemisi yolundaki DNA onarımı için hayati olan FANCD2 gibi ebeveyn genlerinin işlevini modüle edebilir. Genetik varyantlardan sıklıkla etkilenen bozulmuş DNA onarım mekanizmaları, genomik instabilite ve tümör oluşumunun temel itici güçleridir [8]. Hücresel süreçler üzerindeki bu tür genetik etkiler, intraduktal papiller müsinöz neoplazm üzerine yapılan çalışmalarda gözlemlendiği gibi, neoplazm progresyonuna katkıda bulunan faktörler olarak giderek daha fazla kabul edilmektedir[4].
Kanser yatkınlığına dair daha fazla bilgi, karmaşık düzenleyici etkilere sahip olabilen psödogenlerdeki varyantlardan gelmektedir.rs62209647 varyantını içeren TPM3P2 - PIGPP3 lokusu, iki psödogeni içerir. TPM3P2, kanser hücresi invazyonu ve metastazında sıklıkla değişen süreçler olan sitoskeleton organizasyonu ve hücre motilitesi için kritik bir protein olan Tropomyosin 3 (TPM3)‘ün bir psödogenidir. PIGPP3, GPI-bağlı proteinlerin biyosentezinde rol oynayan ve kanserle ilişkili hücre yüzeyi etkileşimlerini ve sinyal yollarını etkileyen PIGPP’ün bir psödogenidir. Bu psödogen bölgelerindeki varyantlar, rs62209647 gibi, ilgili fonksiyonel genlerinin ekspresyonunu veya stabilitesini etkileyebilir veya rekabetçi endojen RNA’lar olarak işlev görerek, neoplastik gelişim için kritik olan hücresel yapıyı, adezyonu ve sinyalleşmeyi dolaylı olarak etkileyebilir. Genetik yatkınlıklardan sıklıkla etkilenen inflamatuar süreçlerin, çeşitli kanserlerin gelişimine ve ilerlemesine önemli ölçüde katkıda bulunduğu bilinmektedir [4]. Bu karmaşık genetik etkileşimleri anlamak, foliküler lenfoma gibi hastalıklar için belirli risk lokuslarının belirlenmesi de dahil olmak üzere, kanserin altında yatan mekanizmalar hakkında daha geniş bir bakış açısı sunmaktadır [3].
Sınıflandırma, Tanım ve Terminoloji
Section titled “Sınıflandırma, Tanım ve Terminoloji”Temel Tanım ve Kavramsal Çerçeveler
Section titled “Temel Tanım ve Kavramsal Çerçeveler”Neoplazm, temel olarak, kontrolsüz hücre büyümesinden kaynaklanan, sıklıkla maligniteye ilerleme potansiyeli taşıyan anormal bir doku kitlesi olarak tanımlanır[4]. Bu kontrolsüz çoğalma, onu normal doku büyümesi ve onarımından ayırır. Neoplazm duyarlılığını anlamaya yönelik kavramsal çerçeve, çeşitli kanser türleriyle ilişkili spesifik genetik lokusları tanımlayan çok sayıda genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS) tarafından gösterildiği gibi, sıklıkla genetik belirleyicileri içerir[9], [10], [1], [7]. Bu çalışmalar, bireyleri bu tür anormal büyümeler geliştirmeye yatkın hale getiren genetik temelleri ortaya çıkarmayı amaçlar [6], [11]. “Tümör belirteci” geniş kategorisi, biyolojik sınıflandırmalar içinde önemli bir gösterge olarak da kabul edilir ve bir neoplazm varlığında yüksek olabilecek maddeleri işaret eder[12].
Kategorizasyon ve Klinik Alt Tipler
Section titled “Kategorizasyon ve Klinik Alt Tipler”Neoplazmlar, doku kökenleri, morfolojileri ve davranışlarına göre çeşitli klinik alt tiplere ayrılır. Örnekler arasında epitel hücrelerinden köken alan karsinomlar ve lenfositlerden kaynaklanan lenfomalar bulunmaktadır. Araştırmalarla tanımlanan spesifik tipler arasında nazofaringeal karsinom [9], [7], oral kanser[11], endometrial kanser[1], kolorektal kanser[13], [8] ve üst aerodigestif sistem kanserleri [5] yer almaktadır. Lenfomalar, foliküler lenfoma ve diffüz büyük B hücreli lenfoma gibi alt tiplere ayrılmakta olup, çalışmalar bu farklı antite’ler arasında ortak genetik yatkınlık olduğunu göstermektedir [6], [14], [3]. İntraduktal papiller müsinöz neoplazm (IPMN), kritik bir sınıflandırma özelliğini vurgular: belirli bir neoplastik tip içinde bir ciddiyet derecesini veya gelişimsel evreyi ifade eden “maligniteye ilerleme” kavramını[4]. Ayrıca, genetik karakterizasyon, aynı lokustaki farklı genetik varyantların yatkınlığa katkıda bulunduğu “allelik heterojeniteyi” ortaya çıkarabilir; bu durum foliküler lenfomada gözlemlenmiştir [6].
Tanı ve Ölçüm Terminolojisi
Section titled “Tanı ve Ölçüm Terminolojisi”Neoplazmların tanısı ve ölçümü, klinik, patolojik ve giderek artan bir şekilde genetik kriterlerin birleşimine dayanmaktadır. “Tümör belirteçleri”, klinik ortamlarda bir tümörün varlığını tespit etmek, ilerlemesini izlemek veya tedavi yanıtını değerlendirmek için kullanılan bir biyobelirteç sınıfını temsil eder [12]. Araştırmalarda, GWAS aracılığıyla tanımlanan “genetik yatkınlık lokusları”, belirli neoplazmları geliştirme riskini artıran spesifik genetik varyantları belirleyerek temel tanı ve ölçüm kriterleri olarak hizmet eder [1], [3], [14], [11], [5], [4], [6]. Bu çalışmalar, “vakaları” belirlenmiş klinik kriterlere göre tanımlayarak onları “kontrollerden” ayırır [5], [8]. Ayrıca, genetik analizlerde, p-değerleri (örn. Hardy-Weinberg dengesi için P < 1 x 10^-5 veya anlamlılık için P <= 2.18 x 10^-11) gibi istatistiksel eşikler ve sağlam bulgular sağlamak amacıyla genetik veriler için kalite kontrol filtreleri içeren katı “araştırma kriterleri” uygulanır [15], [8]. “Nazofarenks karsinomu” ve “intraduktal papiller müsinöz neoplazm” gibi terimlerin tutarlı kullanımı, onkolojide kesin tanı ve iletişim için kritik olan standart bir nomenklatürü yansıtmaktadır.
Belirtiler ve Semptomlar
Section titled “Belirtiler ve Semptomlar”Neoplazmlar, çeşitli klinik ve tanısal yaklaşımlarla tespit edilebilen geniş bir değişiklik spektrumu aracılığıyla kendini gösterir. Klinik tablo, genetik faktörler ve neoplazmın spesifik tipinden etkilenerek bireyler arasında önemli ölçüde değişebilir. Kapsamlı değerlendirme genellikle objektif ölçümler ve sübjektif semptom bildirimlerinin bir kombinasyonunu içerir.
Çeşitli Klinik Fenotipler ve Tanısal Görüntüleme
Section titled “Çeşitli Klinik Fenotipler ve Tanısal Görüntüleme”Neoplazmlar, çok sayıda vücut sistemini etkileyebilen, topluca fenotip olarak adlandırılan, geniş bir yelpazedeki gözlemlenebilir fiziksel ve fizyolojik değişikliklerle karakterizedir [12]. Bu fenotipler, neoplastik hastalıkların heterojen doğasını yansıtan önemli bir çeşitlilik sergiler. Bu belirtilerin belirlenmesinde objektif değerlendirme yöntemleri esastır ve tanısal görüntüleme kritik bir rol oynamaktadır. Abdominal/koroner BT taramaları, beyin MRG/MRA, abdominal ultrasonografi, özofagogastroduodenoskopi, fundoskopi ve spinal röntgenler gibi teknikler, neoplastik süreçlere işaret eden yapısal anormallikleri veya lezyonları görselleştirmek için kullanılır [12]. Bu gelişmiş görüntüleme modaliteleri aracılığıyla spesifik fenotiplerin belirlenmesi, bir neoplazmın varlığının ve kapsamının karakterizasyonuna yardımcı olarak önemli tanısal değer taşır. Ek olarak, bireyler tarafından bildirilen sübjektif semptomlar, kapsamlı katılımcı tarafından bildirilen fenotipik veriler sağlayarak anket mülakatları aracılığıyla toplanır [12].
Biyobelirteçler ve Sistemik Göstergeler
Section titled “Biyobelirteçler ve Sistemik Göstergeler”Görüntülemenin ötesinde, neoplazmlar belirli biyokimyasal göstergeler ve sistemik değişiklikler aracılığıyla tespit edilebilir ve izlenebilir. Kan ve idrar testleri, geniş bir fizyolojik parametre yelpazesi için objektif ölçümler sunan temel değerlendirme yöntemleri olarak hizmet eder [12]. Bunlar arasında, “tümör belirteçleri” tanısal ve izleme potansiyelleriyle tanınan ayrı bir kategori oluşturur [12]. Bu tümör belirteçleri, diğer fenotiplerle nispeten yüksek derecede bağlantı göstererek, tanısal önemlerinin ve neoplastik aktivitenin potansiyel göstergeleri olarak rollerinin altını çizer [12]. Dahası, neoplastik süreçler çeşitli biyolojik sistemleri etkileyebilir ve antropometrik ölçümler, serebro-kardiyo-vasküler, sindirim, endokrin ve metabolizma, hematolojik, kas-iskelet, oftalmik, pulmoner ve renal sistemler gibi kategorilerde sınıflandırılan gözlemlenebilir değişikliklere yol açabilir[12]. Bu geniş sistemik tutulum, neoplazmlarla ilişkili geniş klinik fenotip yelpazesinin altını çizer.
Değişkenlik, İlerleme ve Prognostik Belirteçler
Section titled “Değişkenlik, İlerleme ve Prognostik Belirteçler”Neoplazmların klinik görünümü, allelik heterojenite ve paylaşılan genetik yatkınlıklar gibi faktörlerden etkilenerek önemli ölçüde bireyler arası varyasyon ve fenotipik çeşitlilik sergilemektedir [6]. Bu heterojenite, tipik görünümlerden tanısal zorluklar yaratabilecek daha atipik belirtilere kadar uzanan bir dizi klinik fenotipe yol açabilir [6]. UK Biobank ve UCLA ATLAS Community Health Initiative gibi çeşitli popülasyonlardan yararlanan büyük ölçekli genomik çalışmalar, bu varyasyonların altında yatan genetik belirleyicilerin belirlenmesine katkı sağlamaktadır [15], [16], [9]. Neoplazmlar, intraduktal papiller müsinöz neoplazmın maligniteye doğru gelişiminde görüldüğü gibi, ilerleme potansiyelleriyle de karakterize edilir [4]. Bu tür ilerleme paternlerini izlemek, klinik yönetim için kritik öneme sahiptir ve hastalığın dinamik doğasını yansıtmaktadır. Dahası, spesifik klinik korelasyonlar ve genetik faktörler, kolorektal kanser üzerine yapılan çalışmalarda gözlendiği gibi, hastalar için sağkalım sonuçlarını etkileyen prognostik göstergeler olarak işlev görebilir[13]. Bu belirteçleri tanımlamak, hastalık şiddetini değerlendirmek ve hasta seyrini öngörmek için esastır.
Neoplazmın Nedenleri
Section titled “Neoplazmın Nedenleri”Neoplazm, yaygın olarak kanser olarak bilinen, normal hücresel büyüme ve düzenlemeyi bozan genetik faktörler ile çevresel etkilerin karmaşık bir etkileşiminden kaynaklanır. Araştırmalar, neoplazmın çeşitli türlerine yatkınlığın, hem kalıtsal yatkınlıkları hem de dış tetikleyicileri içeren, genellikle çok yönlü olduğunu göstermektedir.
Genetik Yatkınlık ve Kalıtsal Duyarlılık
Section titled “Genetik Yatkınlık ve Kalıtsal Duyarlılık”Neoplazm gelişimi, bireyin kalıtsal genetik yapısından önemli ölçüde etkilenmekte olup, çok sayıda çalışma farklı kanser türlerinde belirli duyarlılık lokusları tanımlamıştır. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), çeşitli neoplazmlar için artan riske katkıda bulunan yaygın genetik varyantları ortaya çıkarmış olup, bu hastalıkların birçoğu için poligenik bir mimariyi işaret etmektedir. Örneğin, GWAS ve meta-analizler aracılığıyla tanımlandığı üzere, belirli yaygın varyantlar endometrial kanser riski ile ilişkilendirilmiştir[1]. Benzer şekilde, oral kanser ve intraduktal papiller müsinöz neoplazmın maligniteye doğru ilerlemesi için duyarlılık lokusları tanımlanmıştır[11].
Bazı kanserler, genomun belirli bölgelerinde özellikle güçlü genetik belirleyiciler sergiler. Nazofarenks karsinomu (NPC), örneğin, HLA sınıf I antijen tanıma oluğunu içeren ana genetik belirleyicilere sahiptir ve kromozom 6p21.3’teki HLA bölgesinde birden fazla ilişkili lokus bulunmuştur [9]. Foliküler lenfoma, ayrıca 6p21.32’deki HLA bölgesinde risk lokusları göstermekte olup, bu bölgenin dışında ek duyarlılık lokusları tanımlanmıştır [3]. Bu bulgular, kalıtsal genetik varyasyonların çeşitli neoplazm formlarına nasıl farklı duyarlılık sağlayabileceğini vurgulamaktadır.
Karmaşık Genetik Mimariler ve Allelik Heterojenite
Section titled “Karmaşık Genetik Mimariler ve Allelik Heterojenite”Neoplazm duyarlılığının altında yatan genetik mimari genellikle karmaşıktır ve topluca riski etkileyen birden fazla genetik varyantı içerir. Bu karmaşıklık, aynı genomik bölge içinde veya yakınında bulunan farklı varyantların hastalık duyarlılığına katkıda bulunduğu allelik heterojenite olarak ortaya çıkabilir. Örneğin, foliküler lenfoma üzerine yapılan çalışmalar, 6p21.32 lokusunda allelik heterojeniteyi ortaya koymuş, çeşitli genetik mekanizmaların ortak bir risk yolu üzerinde birleştiğini düşündürmektedir[6]. Bunun ötesinde, HLA bölgesi dışında foliküler lenfoma için tanımlanan beş duyarlılık lokusu gibi birden fazla farklı lokus, bir bireyin genel genetik yatkınlığına topluca katkıda bulunur [14].
Her biri küçük bir bireysel risk taşıyan bu çok sayıda yaygın varyantın birleşik etkisi, bir neoplazm geliştirme olasılığını önemli ölçüde artırabilen poligenik bir risk profili oluşturur. Birçok yaygın neoplazm için genel görünüm, birçok genetik faktör arasında karmaşık bir etkileşimi işaret etmektedir. Buna, nazofarengeal karsinom ile ilişkili CLPTM1L/TERT içinde yeni bir lokus dahildir; bu da kanser riskine yönelik çeşitli genetik katkıları ayrıca vurgulamaktadır[7].
Gen-Çevre Etkileşimleri ve Popülasyona Özgü Risk
Section titled “Gen-Çevre Etkileşimleri ve Popülasyona Özgü Risk”Neoplazmların gelişimi sadece genetik faktörler tarafından belirlenmez; aksine, bir bireyin genetik yatkınlığının dış etkenler tarafından modüle edildiği karmaşık gen-çevre etkileşimlerinden kaynaklanır. Bu dinamik etkileşim, çeşitli popülasyonlar ve coğrafi bölgeler arasında gözlemlenen kanser insidansı farklılıklarını açıklayabilir. Çarpıcı bir örnek, Çin kökenli bireylerde HLA bölgesinde güçlü genetik belirleyiciler gösteren nazofarenks karsinomudur[9]. Bu spesifik popülasyon içindeki belirgin genetik yatkınlık, o bölgelerde yaygın olan çevresel tetikleyicilerle bir etkileşimi güçlü bir şekilde düşündürmekte ve artan bir riske yol açmaktadır.
Epidemiyolojik ilişkilendirme çalışmaları, genetik yatkınlıkların çevresel maruziyetlerle neoplazm gelişimini etkilemek üzere nasıl etkileşime girdiğini de içeren bu daha geniş risk faktörlerini araştırmada kritik bir rol oynamaktadır[7]. Belirli çevresel faktörler her zaman detaylandırılmasa da, popülasyona özgü genetik risk lokuslarının tutarlı bir şekilde tanımlanması, bu genetik hassasiyetlerin sıklıkla belirli çevresel bağlamlar tarafından açığa çıkarıldığı veya şiddetlendirildiği anlamına gelmektedir. Böylece, birçok neoplazm için genel risk, bir bireyin kalıtsal genetik yapısı ile çeşitli çevresel ajanlara kümülatif maruziyeti arasındaki karmaşık etkileşimden ortaya çıkar.
Biyolojik Arka Plan
Section titled “Biyolojik Arka Plan”Neoplazm, genellikle tümör olarak adlandırılan, kontrolsüz hücre büyümesinden kaynaklanan anormal bir doku kitlesini temsil eder. Bu kontrolsüz proliferasyon, genetik değişiklikler, hücresel düzensizlik ve normal fizyolojik süreçlerdeki bozulmaların karmaşık bir etkileşiminden kaynaklanır. Neoplazmın biyolojik altyapısını anlamak, moleküler yolların, genetik yatkınlıkların ve bunların doku ve organ düzeylerindeki tezahürlerinin incelenmesini içerir.
Genetik Yatkınlık ve Moleküler Değişiklikler
Section titled “Genetik Yatkınlık ve Moleküler Değişiklikler”Neoplazmlar, normal hücresel süreçleri bozan genetik değişikliklerden temelde kaynaklanır. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), intraduktal papiller müsinöz neoplazm progresyonu, foliküler lenfoma, oral kanser, endometrial kanser ve nazofaringeal karsinom dahil olmak üzere çeşitli kanserlerle ilişkili spesifik genetik yatkınlık lokuslarının tanımlanmasında etkili olmuştur[4]. Bu yaygın varyantlar, bir bireyin bu anormal büyümeleri geliştirme riskini önemli ölçüde etkileyebilir ve kanser riskinin kalıtsal bileşenini vurgular.
Spesifik genler ve genomik bölgeler, bu yatkınlıkta önemli roller oynar. Örneğin, 6p21.32’deki allelik heterojenite, foliküler lenfoma ile ilişkilidir ve diffüz büyük B hücreli lenfoma ile paylaşılan genetik yatkınlığı düşündürmektedir [6]. HLA sınıf I antijen tanıma oluğu, nazofaringeal karsinom için başlıca bir genetik belirleyicidir [9] ve CLPTM1L/TERT içindeki yeni bir lokus da Çin kökenli bireylerde nazofaringeal karsinom ile ilişkilendirilmiştir [7]. Ek olarak, kolorektal ve endometrial kanser için yaygın yatkınlık polimorfizmleriSH2B3 ve TSHZ1 yakınında tanımlanmıştır [17], spesifik genetik varyasyonların hücresel düzenleyici ağları nasıl bozabileceğini ve neoplastik transformasyon olasılığını nasıl artırabileceğini vurgulamaktadır.
Hücresel Düzensizlik ve Yolak Bozukluğu
Section titled “Hücresel Düzensizlik ve Yolak Bozukluğu”Neoplazm gelişiminin altında yatan genetik değişiklikler, sıklıkla kritik hücresel fonksiyonların ve sinyal yolaklarının düzensizliğine yol açar.CLPTM1L ve TERT gibi genlerin tanımlanması, hücre sağkalımı ve çoğalması için kritik hücresel süreçlerdeki rollerine işaret etmektedir [7]. TERT, telomer uzunluğunu korumak için temel bir enzim olan telomeraz revers transkriptazı kodlar; bu enzim, kanser hücrelerinde sınırsız replikasyonu sağlamak ve normal hücresel yaşlanma mekanizmalarını aşmak amacıyla sıklıkla yeniden aktive edilir.
Bu moleküler yolaklardaki bozukluklar, neoplastik transformasyonun ayırt edici özellikleri olan kontrolsüz hücre büyümesine, programlı hücre ölümüne (apoptoz) dirence ve değişmiş metabolizmaya yol açabilir. Örneğin, HLA bölgesinin nazofarenks karsinomundaki rolü, immün tanıma ve yanıt üzerinde bir etki olduğunu düşündürmektedir [9]. Bu bölgedeki genetik varyasyonlar nedeniyle değişmiş antijen sunumu, kanserli hücrelerin immün sistem tarafından tespit edilmekten ve yok edilmekten kaçmasına potansiyel olarak izin vererek, tümör büyümesini ve ilerlemesini teşvik edebilir. Bu tür moleküler ve hücresel düzensizlikler, neoplazinin başlamasının ve devam etmesinin temelini oluşturur.
Patofizyolojik Mekanizmalar ve Hastalık Progresyonu
Section titled “Patofizyolojik Mekanizmalar ve Hastalık Progresyonu”Neoplazmlar, hücrelerde biriken genetik ve epigenetik değişikliklerin tetiklediği normal fizyolojik homeostazın derin bir bozulmasını temsil eder. Bu bozulma, intraduktal papiller müsinöz neoplazm gibi benign durumların maligniteye doğru ilerlemesi şeklinde kendini gösterebilir[4]. Oral kanser, endometrial kanser ve çeşitli lenfomalar gibi farklı kanserlerin gelişimi, kendine özgü patofizyolojik mekanizmalar içerse de, hepsi kontrolsüz hücresel proliferasyon ve bozulmuş doku regülasyonu gibi ortak bir tema paylaşır[11].
Bu hastalıkların progresyonu, kanser hücrelerinin kontrolsüz büyümesine, çevresindeki dokuları istila etmesine ve potansiyel olarak uzak bölgelere metastaz yapmasına olanak tanıyan yeteneklerin kademeli olarak kazanılmasıyla karakterizedir. Kapsamlı genom çapında ilişkilendirme çalışmaları aracılığıyla belirlenen genetik yatkınlık, bir bireyin doğuştan gelen genetik yapısının bu patofizyolojik durumları geliştirme riskine önemli ölçüde katkıda bulunduğunu göstermektedir[4]. Bu durum, neoplastik hastalıkların etiyolojisi ve progresyonunda genetik yatkınlık, çevresel faktörler ve yaşam tarzı seçimleri arasındaki karmaşık etkileşimi vurgulamaktadır.
Dokuya Özgü Belirtiler ve Sistemik Etki
Section titled “Dokuya Özgü Belirtiler ve Sistemik Etki”Neoplazmların etkisi, köken aldığı doku veya organa bağlı olarak önemli ölçüde değişir ve çok çeşitli klinik tablolara ve sistemik sonuçlara yol açar. Örneğin, intraduktal papiller müsinöz neoplazmlar başlıca pankreas veya safra kanallarını etkiler [4], foliküler lenfoma ise lenfatik sistemi, özellikle lenf düğümlerini etkiler [6]. Oral kanser ağız boşluğunu etkiler[11], endometrial kanser uterusun iç zarında gelişir[1] ve nazofarenks karsinomu nazofarenkste köken alır [9]. Üst aerodigestif sistem kanserleri ağız, farinks ve larinks gibi bölgeleri etkileyebilir [5].
Bu organa özgü etkiler, etkilenen dokunun normal işlevini ciddi şekilde bozarak ağrı, kanama veya tıkanıklık gibi lokalize semptomlara yol açabilir. Bu anormal büyümelerin varlığı, inflamasyon, immün yanıtlar ve tümör büyümesini daha da destekleyen mikroçevredeki değişiklikler dahil olmak üzere karmaşık doku etkileşimlerini de tetikleyebilir. İleri evrelerde, neoplazmlar uzak organlara yayılarak (metastaz) veya vücut genelindeki hayati fizyolojik süreçlere müdahale ederek daha geniş sistemik sonuçlara yol açabilir ve nihayetinde genel sağlığı ve sağkalımı etkileyebilir. Bu dokuya özgü belirtileri anlamak, doğru tanı, hedefe yönelik tedavi ve prognozu tahmin etmek için çok önemlidir.
Yolaklar ve Mekanizmalar
Section titled “Yolaklar ve Mekanizmalar”Neoplazmın gelişimi ve ilerlemesi, sıklıkla genetik yatkınlıktan etkilenen karmaşık moleküler yolakları ve düzenleyici mekanizmaları içerir. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), çeşitli neoplazmların riski ve ilerlemesi ile ilişkili çok sayıda genetik lokus tanımlayarak, temel biyolojik süreçlere ışık tutmuştur. Bu çalışmalar, değişmiş gen regülasyonundan immün sistem disregülasyonuna ve daha geniş sistem düzeyindeki etkileşimlere kadar uzanan mekanizmalara işaret etmektedir.
Genetik Yatkınlık ve Düzenleyici Mekanizmalar
Section titled “Genetik Yatkınlık ve Düzenleyici Mekanizmalar”Neoplazm gelişiminde genetik yatkınlık temel bir rol oynamakta olup, GWAS aracılığıyla tanımlanan belirli yaygın varyantlar artmış risk ile ilişkilidir. Örneğin, çalışmalar, intraduktal papiller müsinöz neoplazmın maligniteye ilerlemesiyle ilişkili lokusları[4]‘nın yanı sıra, oral kanser[11], endometrial kanser[1] ve foliküler lenfoma [6] için yatkınlık lokusları tanımlamıştır. Bu genetik varyasyonlar, gen regülasyonunu etkileyerek kritik hücresel yolların düzensizliğine yol açabilir. Bu tür düzenleyici mekanizmalar; transkripsiyon faktörü bağlanmasındaki değişiklikleri, mRNA stabilitesindeki değişimleri veya protein ekspresyonundaki modifikasyonları içerir ve topluca neoplastik büyümenin başlamasına ve ilerlemesine katkıda bulunur.
Bağışıklık Sistemi Katılımı: HLA Lokusları Aracılığıyla
Section titled “Bağışıklık Sistemi Katılımı: HLA Lokusları Aracılığıyla”Çeşitli neoplazmlarda önemli bir mekanizma, Majör Histokompatibilite Kompleksi (MHC) ve özellikle İnsan Lökosit Antijeni (HLA) bölgesini içerir. HLA sınıf I antijen tanıma oluğu, Çin kökenli bireylerde nazofaringeal karsinom (NPC) için başlıca bir genetik belirleyici olarak tanımlanmıştır [9]. Ayrıca, çok sayıda NPC ile ilişkili lokus, kromozom 6p21.3’teki HLA bölgesinde bulunur [2] ve CLPTM1L/TERT içindeki belirli bir lokus da NPC ile ilişkilidir [7]. Foliküler lenfoma için, yine HLA bölgesi içinde yer alan 6p21.32’deki allelik heterojenite, diffüz büyük B hücreli lenfoma ile ortak genetik duyarlılık olduğunu düşündürmektedir [6]. Bu bulgular, genetik varyasyonların bağışıklık sisteminin anormal hücreleri tespit etme ve ortadan kaldırma yeteneğini bozabileceği kanser patogenezinde bağışıklık sinyal yollarının ve hücresel tanımanın kritik rolünün altını çizmektedir.
Hücresel Çoğalma ve Genomik Bütünlük Yolları
Section titled “Hücresel Çoğalma ve Genomik Bütünlük Yolları”Hücresel çoğalma ve genomik bütünlüğün sürdürülmesi ile ilgili mekanizmalar, neoplazm için de merkezidir. Nazofaringeal karsinom ile ilişkili CLPTM1L/TERT lokusu gibi genetik lokusların tanımlanması, temel hücre süreçlerinde yer alan genleri vurgulamaktadır[7]. TERT (Telomeraz Ters Transkriptaz), telomer uzunluğunu sürdürmek için hayati bir enzim olan telomerazın anahtar bir bileşenidir. Telomer bakımındaki düzensizlik, genomik instabiliteye ve kontrolsüz hücresel replikasyona yol açarak, neoplastik transformasyon ve büyüme için elverişli bir ortam yaratabilir.
Yolak Çapraz Konuşması ve Pleyotropik Etkiler
Section titled “Yolak Çapraz Konuşması ve Pleyotropik Etkiler”Neoplazm gelişimi, yolak çapraz konuşması ve pleyotropik genetik etkilerle karakterize edilen karmaşık sistem düzeyinde bir entegrasyonu sıklıkla içerir. Bir genom çapında ilişkilendirme meta-analizi, aerodigestif skuamöz hücreli kanserler için pleyotropik risk lokusları tanımlamıştır; bu da belirli genetik varyantların birden fazla kanser tipinde etki gösterebildiğini veya birbirine bağlı birçok biyolojik yolu etkileyebildiğini göstermektedir[18]. Bu durum, tek bir genetik değişikliğin geniş sonuçlara yol açabileceği, çeşitli hücresel işlevleri etkileyebileceği ve kanserin ortaya çıkan özelliklerine katkıda bulunabileceği bir etkileşim ağına işaret etmektedir. Bu tür bulgular, ortak genetik faktörlerin bireyleri farklı ancak ilişkili neoplastik durumlara yatkın hale getirebildiği biyolojik sistemlerdeki karmaşık hiyerarşik düzenlemeyi vurgulamaktadır.
Klinik Önemi
Section titled “Klinik Önemi”Neoplazmın genetik temellerini anlamak, erken risk değerlendirmesinden kişiselleştirilmiş tedavi stratejilerine kadar hasta bakımını ilerletmek için hayati öneme sahiptir. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), çeşitli kanser türleriyle ilişkili çok sayıda genetik lokus tanımlamıştır; bu da hastalık duyarlılığına, ilerlemesine ve tedaviye yanıta dair değerli bilgiler sağlamaktadır. Bu keşifler, bireysel genetik profillere göre uyarlanmış daha hassas tanısal, prognostik ve terapötik yaklaşımlara olanak tanır.
Genetik Risk Değerlendirmesi ve Erken Teşhis
Section titled “Genetik Risk Değerlendirmesi ve Erken Teşhis”Genetik araştırmalar, belirli neoplazmlar geliştirme riski yüksek olan bireyleri belirlemek için önemli bir potansiyel sunmakta, böylece kişiselleştirilmiş önleme ve erken teşhis stratejilerini kolaylaştırmaktadır. Çalışmalar, çeşitli kanserler için duyarlılık lokusları tanımlamıştır; bunlar arasında HLA bölgesi dışındaki foliküler lenfoma için beş lokus [14], foliküler lenfoma için 6p21.32’de bir risk lokusu [3], Tayvan’da ağız kanseri için yeni genetik duyarlılık lokusları[11] ve endometriyal kanserle ilişkili yaygın varyantlar [1] bulunmaktadır. Ayrıca, nazofarenks karsinomu için spesifik genetik belirleyiciler, özellikle HLA sınıf I antijen tanıma oluğu içinde ve CLPTM1L/TERT içinde yeni bir lokus, Çin kökenli bireylerde tanımlanmıştır [7]. Bu bulgular, risk sınıflandırması için kritik öneme sahiptir ve klinisyenlerin yüksek riskli popülasyonlarda veya belirli atalardan kalma geçmişe sahip kişilerde gözetim ve önleyici müdahaleleri daha etkili bir şekilde hedeflemesine olanak tanır.
Prognostik Belirteçler ve Tedavi Yanıtı
Section titled “Prognostik Belirteçler ve Tedavi Yanıtı”Genetik belirteçler, neoplastik hastalıkların klinik seyrini tahmin etmede ve tedavi kararlarına rehberlik etmede de hayati bir rol oynamaktadır. Örneğin, intraduktal papiller müsinöz neoplazmın maligniteye doğru ilerlemesiyle ilişkili olduğu belirlenen sekiz spesifik lokus tanımlanmıştır ve bu durum kritik prognostik bilgi sağlamaktadır [4]. Kolorektal kanserde, genel sağkalım ve hastalıksız sağkalım ile genetik ilişkiler araştırılmış, beklenen hasta sonuçlarına dair öngörüler sunulmuştur[13]. Bu tür prognostik genetik belirteçler, izlemin yoğunluğunu, tedavi rejimlerinin seçimini ve uzun vadeli sonuçların yönetimini bilgilendirerek, hasta sağkalımını ve yaşam kalitesini optimize eden daha bireyselleştirilmiş tedavi yollarına doğru ilerlemeyi sağlayabilir.
Ortak Genetik Yatkınlık ve Fenotipik Örtüşme
Section titled “Ortak Genetik Yatkınlık ve Fenotipik Örtüşme”Genetik yatkınlıkların araştırılması, farklı neoplazm tipleri arasında ortak yatkınlık örneklerini ortaya çıkarmış, ortak temel biyolojik mekanizmaları ve potansiyel olarak örtüşen fenotipleri vurgulamıştır. Araştırmalar, 6p21.32’de allelik heterojenite olduğunu ve bunun foliküler lenfoma ile diffüz büyük B hücreli lenfoma arasında ortak bir genetik yatkınlık olduğunu düşündürdüğünü belirtmektedir[6]. Bu anlayış, karmaşık kanser etiyolojilerini anlamak ve birden fazla ilişkili malignite riski taşıyabilecek bireyleri belirlemek için çok önemlidir. Bu ortak genetik bağlantıların tanınması, kapsamlı risk değerlendirmelerine bilgi sağlayabilir ve ilgili neoplastik durumların geniş bir yelpazesine uygulanabilir daha geniş önleyici stratejilerin veya hedefe yönelik tedavilerin geliştirilmesine yol açabilir.
Önemli Varyantlar
Section titled “Önemli Varyantlar”| RS ID | Gen | İlişkili Özellikler |
|---|---|---|
| rs12203592 | IRF4 | Cilt Pigmentasyonu Anormalliği eye color hair color freckles progressive supranuclear palsy |
| rs1805007 | MC1R | Cilt Pigmentasyonu Anormalliği melanoma skin sensitivity to sun hair color freckles |
| rs189122415 | LINC03090 | Neoplazm |
| rs16891982 | SLC45A2 | skin sensitivity to sun melanoma eye color hair color Cilt Pigmentasyonu Anormalliği |
| rs62209647 | TPM3P2 - PIGPP3 | Skuamöz Hücreli Karsinom blood protein amount health trait non-melanoma skin carcinoma BMI-adjusted hip circumference |
| rs140758620 | TYR - NOX4 | Neoplazm phototoxic dermatitis |
| rs11018578 | NOX4 | Cilt Hastalığı Neoplazm |
| rs189086286 | FANCD2P2 | Neoplazm |
Neoplazm Hakkında Sıkça Sorulan Sorular
Section titled “Neoplazm Hakkında Sıkça Sorulan Sorular”Bu sorular, güncel genetik araştırmalara dayalı olarak neoplazmın en önemli ve spesifik yönlerini ele almaktadır.
1. Ailemde kanser öyküsü var. Bu, kansere yakalanma olasılığımın daha yüksek olduğu anlamına mı geliyor?
Section titled “1. Ailemde kanser öyküsü var. Bu, kansere yakalanma olasılığımın daha yüksek olduğu anlamına mı geliyor?”Evet, ailenizde kanser varsa, yatkınlığınızı artıran genetik yatkınlıklar miras almış olabilirsiniz. Araştırmalar, HLA bölgesi içinde veya 6p21.32’de bulunanlar gibi, çeşitli neoplazm türleri için artmış risk ile ilişkilendirilen belirli genetik değişiklikler ve loküsler tespit etmiştir. Ancak bu bir garanti değildir, çünkü çevresel faktörler de önemli bir rol oynamaktadır.
2. Sağlıklı bir yaşam tarzı, kanser için genetik riskimi gerçekten aşabilir mi?
Section titled “2. Sağlıklı bir yaşam tarzı, kanser için genetik riskimi gerçekten aşabilir mi?”Sağlıklı bir yaşam tarzı kesinlikle yardımcı olabilir, ancak bu karmaşık bir etkileşimdir. Genetik yatkınlıkları miras almış olsanız da, çevresel faktörler ve yaşam tarzı seçimleri de neoplazm gelişimini etkiler. Sağlıklı seçimler yapmak, bu genetik riskin bir kısmını potansiyel olarak azaltabilir, ancak alt yatan genetik yatkınlığı tamamen ortadan kaldırmaz.
3. Ailemin etnik kökeni belirli kanser riskimi etkiler mi?
Section titled “3. Ailemin etnik kökeni belirli kanser riskimi etkiler mi?”Evet, atalarınızın kökeni riskinizi etkileyebilir. Neoplazmlar için genetik risk faktörleri genellikle popülasyona özgü paternler gösterir; yani bir atalar grubundan elde edilen bulgular diğerlerine tam olarak genellenebilir olmayabilir. Örneğin, Çin popülasyonlarında tanımlanan nazofarenks karsinomu için başlıca genetik belirleyiciler, HLA sınıf I antijen tanıma oluğunu içerir.
4. Genetik bir test kişisel kanser riskim hakkında bana ne söylerdi?
Section titled “4. Genetik bir test kişisel kanser riskim hakkında bana ne söylerdi?”Bir genetik test, belirli neoplazmlar için riskinizi artırabilecek spesifik genetik değişiklikleri veya yatkınlık lokuslarını tanımlayabilir. Bu bilgi, kişiselleştirilmiş önleyici tedbirlerin belirlenmesine yardımcı olabilir ve doktorunuzla, tespiti amaçlayan daha erken veya daha sık taramalar hakkında yapacağınız görüşmelere rehberlik edebilir.
5. Eğer kansere yakalanırsam, genlerim doktorlarımın beni daha iyi tedavi etmesine yardımcı olabilir miydi?
Section titled “5. Eğer kansere yakalanırsam, genlerim doktorlarımın beni daha iyi tedavi etmesine yardımcı olabilir miydi?”Evet, kesinlikle. Sizin belirli neoplazmınızın benzersiz genetik yapısını anlamak, kişiselleştirilmiş tedavi planlarına yol gösterebilir. Bu, doktorların sizin özel kanseriniz için potansiyel olarak daha etkili tedavileri uyarlamasına olanak tanır ve bu da daha iyi sonuçlara yol açar.
6. Bazı insanlar sağlıklı bir yaşam sürerken bile neden kanser olur?
Section titled “6. Bazı insanlar sağlıklı bir yaşam sürerken bile neden kanser olur?”Neoplazm gelişimi, kendiliğinden meydana gelebilen veya kalıtsal olabilen, hücrelerdeki genetik değişikliklere dayanır. Sağlıklı bir yaşam tarzı riski azaltabilse de, bireyler çok sağlıklı bir yaşam sürdükleri görünse bile, bu temel genetik faktörler veya her zaman belirgin olmayan diğer çevresel maruziyetler nedeniyle yine de kansere yakalanabilir.
7. ‘Kanserli Olmayan’ Bir Büyüme Daha Sonra Daha Ciddi Bir Şeye Dönüşebilir mi?
Section titled “7. ‘Kanserli Olmayan’ Bir Büyüme Daha Sonra Daha Ciddi Bir Şeye Dönüşebilir mi?”Evet, mümkündür. Birçok iyi huylu (kanserli olmayan) büyüme zararsız kalsa da, genetik faktörler, intraduktal papiller müsinöz neoplazm gibi belirli durumların maligniteye (kansere) doğru ilerlemesindeki rolleri açısından aktif olarak incelenmektedir. Düzenli takip ve bu genetik içgörüleri anlamak, bu tür büyümeler için önemlidir.
8. Kanser olmak sadece rastgele kötü şans mı, yoksa genlerim büyük bir rol oynuyor mu?
Section titled “8. Kanser olmak sadece rastgele kötü şans mı, yoksa genlerim büyük bir rol oynuyor mu?”Bu, sadece kötü şanstan çok daha fazlası; genleriniz önemli bir rol oynar. Neoplazm gelişiminin biyolojik temeli, kalıtsal olabilen veya zamanla ortaya çıkabilen genetik değişikliklere dayanır. Bu, bu kalıtsal yatkınlıklar ile çeşitli çevresel faktörler arasında karmaşık bir etkileşimdir.
9. Yeni kanser araştırmalarını duyduğumda, benim gibi insanlara uygulanacak mı?
Section titled “9. Yeni kanser araştırmalarını duyduğumda, benim gibi insanlara uygulanacak mı?”Her zaman doğrudan değil. Neoplazmlar için genetik risk faktörleri popülasyona özgü olabilir; yani bir ata grubundan elde edilen bulgular, diğerlerinde tam olarak uygulanamayabilir veya aynı öngörü değerine sahip olmayabilir. Bu durum, bulguların adil bir şekilde uygulanmasını sağlamak için genetik araştırmalarda çeşitli temsilin önemini vurgulamaktadır.
10. Kanser olursam, genlerim ne kadar ciddi olabileceğini tahmin etmeme yardımcı olabilir mi?
Section titled “10. Kanser olursam, genlerim ne kadar ciddi olabileceğini tahmin etmeme yardımcı olabilir mi?”Evet, genetik bilgiler, kanserin prognozu olarak da bilinen muhtemel seyrini tahmin etmede önemli bir rol oynayabilir. Neoplazmınızdaki spesifik genetik alterasyonları anlamak, doktorların potansiyel agresifliğini değerlendirmesine ve en uygun tedavi ve izleme kararlarını yönlendirmesine yardımcı olabilir.
Bu SSS, güncel genetik araştırmalara dayanarak otomatik olarak oluşturulmuştur ve yeni bilgiler ortaya çıktıkça güncellenebilir.
Yasal Uyarı: Bu bilgiler yalnızca eğitim amaçlıdır ve profesyonel tıbbi tavsiye yerine kullanılmamalıdır. Kişiselleştirilmiş tıbbi rehberlik için daima bir sağlık uzmanına danışın.
References
Section titled “References”[1] Spurdle, A. B. et al. “Genome-wide association study identifies a common variant associated with risk of endometrial cancer.”Nat Genet.
[2] Tse, K. P., et al. “Genome-wide association study reveals multiple nasopharyngeal carcinoma-associated loci within the HLA region at chromosome 6p21.3.” Am J Hum Genet, 2009.
[3] Conde, L. et al. “Genome-wide association study of follicular lymphoma identifies a risk locus at 6p21.32.” Nat Genet.
[4] Gentiluomo, M. et al. “A genome-wide association study identifies eight loci associated with intraductal papillary mucinous neoplasm progression toward malignancy.”Cancer. 2025.
[5] McKay, J. D. et al. “A genome-wide association study of upper aerodigestive tract cancers conducted within the INHANCE consortium.” PLoS Genet. March 2011.
[6] Smedby, K. E. et. al. “GWAS of follicular lymphoma reveals allelic heterogeneity at 6p21.32 and suggests shared genetic susceptibility with diffuse large B-cell lymphoma.” PLoS Genet. April 2011.
[7] Bei, J. X. et al. “A GWAS Meta-analysis and Replication Study Identifies a Novel Locus within CLPTM1L/TERT Associated with Nasopharyngeal Carcinoma in Individuals of Chinese Ancestry.” Cancer Epidemiol Biomarkers Prev.
[8] Garcia-Etxebarria, K., et al. “Performance of the Use of Genetic Information to Assess the Risk of Colorectal Cancer in the Basque Population.”Cancers (Basel), vol. 14, no. 17, 2022, p. 4193. PMID: 36077729.
[9] Tang, M. et al. “The principal genetic determinants for nasopharyngeal carcinoma in China involve the HLA class I antigen recognition groove.” PLoS Genet. November 2012.
[10] McCoy, Thomas H., et al. “Efficient genome-wide association in biobanks using topic modeling identifies multiple novel disease loci.” Molecular Medicine, vol. 23, 2017, pp. 285-294.
[11] Bau, D. T. et al. “A Genome-Wide Association Study Identified Novel Genetic Susceptibility Loci for Oral Cancer in Taiwan.”Int J Mol Sci.
[12] Choe, E. K., et al. “Leveraging Deep Phenotyping from Health Check-Up Cohort with 10,000 Korean Individuals for Phenome-Wide Association Study of 136 Traits.” Scientific Reports.
[13] Xu, W., et al. “A Genome Wide Association Study on Newfoundland Colorectal Cancer Patients’ Survival Outcomes.”Biomarkers in Research, 2015.
[14] Skibola, C. F. et al. “Genome-wide association study identifies five susceptibility loci for follicular lymphoma outside the HLA region.” Am J Hum Genet.
[15] Backman, Joshua D., et al. “Exome Sequencing and Analysis of 454,787 UK Biobank Participants.” Nature, vol. 599, no. 7886, 2021, pp. 628-634.
[16] Johnson, R., et al. “Leveraging Genomic Diversity for Discovery in an Electronic Health Record Linked Biobank: The UCLA ATLAS Community Health Initiative.” Genome Medicine, vol. 14, no. 1, 2022, p. 102.
[17] Cheng, T. H. et al. “Meta-analysis of genome-wide association studies identifies common susceptibility polymorphisms for colorectal and endometrial cancer near SH2B3 and TSHZ1.”Sci Rep.
[18] Lesseur, C. et al. “Genome-wide association meta-analysis identifies pleiotropic risk loci for aerodigestive squamous cell cancers.” PLoS Genet.