İçeriğe geç

Clostridium Difficile Enfeksiyonu

Clostridium difficile enfeksiyonu (CDI), günümüzde sıklıkla Clostridioides difficile enfeksiyonu olarak adlandırılır ve Clostridioides difficilebakterisinin neden olduğu önemli bir halk sağlığı sorunudur. Hafif ishalden, psödomembranöz kolit olarak bilinen şiddetli, yaşamı tehdit eden kolon iltihabına kadar değişen semptomlarla karakterizedir. Bu enfeksiyon en sık, normal bağırsak mikrobiyotasını bozarakC. difficile’nin çoğalmasına izin veren antibiyotik kullanımıyla ilişkilidir.

Clostridioides difficile anaerobik, spor oluşturan bir bakteridir. Patojenik etkileri öncelikle toksinlerin, özellikle de TcdA (toksin A) ve TcdB (toksin B) üretiminden kaynaklanmaktadır. Bu toksinler, bağırsak astarına zarar vererek inflamasyona, sıvı salgılanmasına ve hücre ölümüne yol açar. Bakterinin spor oluşturma yeteneği, birçok dezenfektana ve antibiyotiğe karşı yüksek direnç göstermesini sağlar ve bu da sağlık hizmeti ortamlarındaki kalıcılığına ve bulaşmasına katkıda bulunur. Genellikle geniş spektrumlu antibiyotikler tarafından tetiklenen bağırsak mikrobiyal dengesinin bozulması, C. difficile’nin gelişebileceği ve bu toksinleri üretebileceği bir ortam yaratarak hastalığa yol açar.

CDI, geniş bir klinik belirti yelpazesi sunar. Hafif vakalar sulu ishal içerirken, şiddetli vakalar karın ağrısı, ateş, kanlı dışkı ve toksik megakolon, bağırsak perforasyonu ve sepsis gibi komplikasyonlara ilerleyebilir. CDI yönetimindeki önemli bir zorluk, genellikle sporların devamlılığı veya ilk tedaviden sonra bağırsak mikrobiyomunun eksik restorasyonu nedeniyle yüksek nüks oranıdır. Küresel olarak sağlık hizmetiyle ilişkili enfeksiyonların önde gelen bir nedenidir ve sağlık sistemleri üzerinde önemli bir yük oluşturmaktadır.

Clostridioides difficileenfeksiyonunun sosyal önemi, yaygınlığı, şiddeti ve önlenmesi ve tedavisindeki zorluklardan kaynaklanmaktadır. Özellikle yaşlılar ve altta yatan sağlık sorunları olanlar arasında hasta morbidite ve mortalitesine önemli ölçüde katkıda bulunur. Sağlık sistemleri üzerindeki ekonomik etkisi, uzun süren hastanede kalışlar, artan kaynak kullanımı ve tekrarlayan enfeksiyonların tedavi maliyetleri nedeniyle önemlidir. Halk sağlığı çalışmaları, enfeksiyon kontrol önlemlerine, ihtiyatlı antibiyotik reçetelerine ve bu kalıcı patojenle mücadele etmek için fekal mikrobiyota transplantasyonu da dahil olmak üzere yeni tedavilerin ve önleyici stratejilerin geliştirilmesine odaklanmaktadır. Genetik varyasyonların bulaşıcı hastalıklara duyarlılığı etkileyebileceği gibi, polimorfizmler gibi konakçı genetik faktörlerini anlamak, sonunda bu ciddi, yaygın enfeksiyonun yönetimine katkıda bulunabilir.[1]

Metodolojik ve İstatistiksel Kısıtlamalar

Section titled “Metodolojik ve İstatistiksel Kısıtlamalar”

Genetik ilişkilendirme çalışmaları, özellikle genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), bulgularının yorumlanmasını ve genellenebilirliğini etkileyebilecek çeşitli doğal sınırlamalarla karşı karşıyadır. Enfeksiyon hastalıklarındaki çalışmalar genellikle örneklem büyüklüğü ile ilgili zorluklarla karşılaşır ve bu da anlamlı ilişkileri tespit etme gücünü doğrudan etkiler. Geniş kohortlar, 1,20 veya daha büyük odds oranları gibi orta düzeyde etki büyüklüğüne sahip yaygın varyantları tespit etmek için yeterli gücü sağlayabilirken, nadir görülen nedensel varyantları belirleme yeteneği, kapsamlı imputasyon çabalarıyla bile genellikle yetersiz kalmaktadır.[1]Bu sınırlama, karmaşık enfeksiyon özelliklerinde duyarlılığa veya sonuca katkıda bulunan genetik bileşenin önemli bir bölümünün, potansiyel olarak sınırlı penetransa sahip çok sayıda nadir mutasyon tarafından yönlendirilen, keşfedilmemiş kalabileceğini düşündürmektedir.[1] Ayrıca, gerçek genetik ilişkileri belirlemek, replikasyon zorlukları ve anlamlılık eşiklerinin yorumlanmasıyla daha da karmaşık hale gelmektedir. Replikasyon için en güçlü kanıtlara sahip olan SNP’lerin, ilk keşif analizlerinden elde edilen en iyi ilişkiler olmaması yaygındır ve bu da en güçlü istatistiksel sinyallerin ve altta yatan gerçek nedensel varyantların her zaman aynı olmadığını göstermektedir.[2] Geniş replikasyon stratejileri ve uygun çoklu test düzeltmeleri uygulandığında bile, meta-analiz P-değerleri sürekli olarak sıkı genom çapında anlamlılık eşiklerini karşılamayabilir ve bu da bulguların dikkatli bir şekilde yorumlanmasını gerektirir.[2] Ek olarak, ortalama veya düşük duyarlılığa sahip bireylerin vaka grubuna dahil edilebileceği potansiyel vaka yanlış sınıflandırması, istatistiksel gücü daha da azaltabilir ve yeni varyant keşfi için daha büyük etki büyüklükleri gerektirebilir.[3]

Genellenebilirlik ve Fenotipik Tanım Zorlukları

Section titled “Genellenebilirlik ve Fenotipik Tanım Zorlukları”

Genetik ilişkilendirme çalışmalarından elde edilen bulguların genellenebilirliği, çalışma popülasyonlarının demografik özellikleri ile sınırlı olabilir. Birçok genetik çalışma, Avrupa kökenli bireyler veya kendini Kuzey Avrupa kökenli olarak tanımlayanlar gibi belirli soylara sahip kohortlarda yürütülmektedir.[1], [4] Temel bileşen analizi, bu gruplar içindeki popülasyon katmanlaşmasını hesaba katmak için sıklıkla kullanılsa da, sonuçlar doğrudan aktarılamayabilir veya diğer çeşitli popülasyonlara genellenemeyebilir ve bu da tanımlanan herhangi bir genetik ilişkinin daha geniş uygulanabilirliğini kısıtlar.[1], [4] Fenotiplerin tanımı ve tespiti de önemli değişkenlik ve potansiyel sınırlamalar getirmektedir. Örneğin, birincil fenotip olarak “tüm Staphylococcus aureus enfeksiyonları” gibi geniş kategoriler kullanmak, metisiline dirençli Staphylococcus aureus(MRSA) enfeksiyonu veya toplum kaynaklı cilt ve yumuşak doku enfeksiyonları (SSTIs) gibi daha spesifik alt tipler yerine, belirli enfeksiyon türleriyle ilgili spesifik genetik sinyalleri zayıflatabilir.[1] Dahası, vakalar için ayrıntılı bakteriyel genotiplemenin olmaması, konakçı genetik yatkınlığını belirli patojen suşları veya onların virülans faktörleri ile ilişkilendirme yeteneğini engelleyebilir.[1] Bir çalışmanın gücü, özellikle enfeksiyona karşı kanıtlanmış veya şüphelenilen direnci olan bireyler için zenginleşme eksikliği varsa, kontrol popülasyonunun bileşiminden de etkilenebilir; bu da yeni koruyucu ilişkilerin keşfini etkileyebilir.[3]

Hesaplanmamış Genetik ve Çevresel Faktörler

Section titled “Hesaplanmamış Genetik ve Çevresel Faktörler”

Genetik araştırmalardaki ilerlemelere rağmen, bulaşıcı hastalıklar da dahil olmak üzere karmaşık özellikler için “kayıp kalıtılabilirliğin” önemli bir kısmı hala açıklanamamaktadır. Yaygın varyantların çeşitli hastalıkların genetik bileşenine katkıda bulunduğu kabul edilmekle birlikte, bu kayıp kalıtılabilirliğin önemli bir kısmı, her biri sınırlı penetrasyona sahip birçok nadir mutasyonun kümülatif etkilerine atfedilebilir.[1] Esas olarak yaygın varyantları tespit etmek için tasarlanan standart GWAS metodolojileri, doğası gereği bu nadir varyantları belirlemede daha az güçlüdür ve önemli genetik etkileri keşfedilmemiş olarak bırakır.[1] Genetik ilişkilendirme çalışmaları tipik olarak regresyon modellerinde yaş, cinsiyet ve popülasyon tabakalaşması gibi bilinen karıştırıcı faktörleri ayarlar.[1]Bununla birlikte, konak genetiği, çeşitli çevresel maruziyetler ve yaşam tarzı faktörleri arasındaki karmaşık etkileşim, kapsamlı bir şekilde hesaba katılması zor olan ölçülmemiş karıştırıcı faktörleri ortaya çıkarabilir. Bu ölçülmemiş çevresel veya gen-çevre etkileşimleri, hastalık duyarlılığını veya ilerlemesini önemli ölçüde değiştirebilir ve bunların analizlerden çıkarılması, gözlemlenen genetik ilişkileri gizleyebilir veya değiştirebilir. Sonuç olarak, ilk taramalarda tanımlanan potansiyel olarak yeni ilişkilerin tam biyolojik önemini ve klinik etkisini belirlemek için genellikle daha fazla araştırma yapılması gerekmektedir.[5]

Genetik varyasyonlar, bir bireyin bağışıklık tepkisini ve Clostridium difficile enfeksiyonu (CDI) dahil olmak üzere çeşitli enfeksiyonlara duyarlılığını şekillendirmede önemli bir rol oynar. İnsan lökosit antijeni (HLA) genleri, kromozom 6 üzerindeki majör histokompatibilite kompleksi (MHC) bölgesinde yer alır ve adaptif bağışıklık sisteminin merkezinde yer alır. Bu genlerdeki varyantlar, vücudun patojenleri nasıl tanıdığını ve bunlara nasıl yanıt verdiğini önemli ölçüde etkileyebilir. Örneğin, HLA-C ve HLA-B, hücre içi antijenleri sitotoksik T hücrelerine sunan MHC Sınıf I moleküllerini kodlarken, HLA-DRB1 ve HLA-DQA1, hücre dışı antijenleri yardımcı T hücrelerine sunan MHC Sınıf II moleküllerini kodlar. HLA-C’ye yakın kodlamayan bir varyant olan rs3134745 , HLA-B’deki rs9266276 ve HLA-DRB1 ve HLA-DQA1 ile bağlantılı rs9271367 , rs9271325 , rs9270664 , antijen sunum etkinliğini veya bu kritik bağışıklık bileşenlerinin ekspresyon seviyelerini değiştirebilir. Bu tür değişiklikler, C. difficiletoksinlerine veya bakteri bileşenlerine karşı daha az etkili bir bağışıklık tepkisine yol açabilir ve bu da duyarlılığı, hastalık şiddetini veya CDI’nın tekrarlanmasını potansiyel olarak etkileyebilir.[6] Çalışmalar, HLA bölgesindeki varyantların çeşitli enfeksiyonlara duyarlılıkla ilişkili olduğunu ve bağışıklık savunması üzerindeki geniş etkilerini vurguladığını göstermiştir.[7] HLA bölgesinin ötesinde, diğer genetik varyasyonlar, dolaylı olarak bağışıklık fonksiyonunu ve genel konak savunmasını destekleyen temel hücresel süreçleri etkiler. DDX39B, SNORD117 ve ATP6V1G2-DDX39B’yi kapsayan bir bölgede bulunan rs114751021 varyantı, RNA işleme ve hücresel enerji ile ilgili genleri etkiler. DDX39B (DEAD-box helikaz 39B), RNA eklenmesi ve taşınması için kritik öneme sahipken, SNORD117, ribozom biyogenezinde yer alan küçük bir nükleolar RNA’dır. ATP6V1G2-DDX39B, hücresel metabolizmayı etkileyebilen bir füzyon gen ürünüdür, çünkü ATP6V1G2, proton taşınmasından sorumlu vakuolar ATPaz’ın bir alt birimidir.[1] Etkili RNA işleme ve hücresel enerji üretimi, CDI gibi enfeksiyonlarla savaşmak için gereken bağışıklık hücrelerinin hızlı çoğalması ve aktivasyonu için gereklidir. Bu genlerdeki varyasyonlar bu nedenle bağışıklık sisteminin zamanında ve etkili bir yanıt verme yeteneğini ince bir şekilde bozabilir ve potansiyel olarak Clostridium difficile enfeksiyonunda artan duyarlılığa veya daha kötü sonuçlara katkıda bulunabilir.

Daha fazla hücresel düzenleme ve protein sentezi, CNOT4’teki rs117373257 ve VARS1’deki rs140091914 , rs707924 , rs707926 gibi varyantlardan etkilenir. CNOT4, mRNA deadenilasyonunda ve gen ekspresyonu düzenlenmesinde rol oynayan CCR4-NOT kompleksinin bir bileşenidir ve böylece çok sayıda transkriptin stabilitesini ve translasyonunu etkiler. VARS1, tüm protein sentezi için bir ön koşul olan valini kendi tRNA’sına yüklemek için hayati bir enzim olan valil-tRNA sentetazı kodlar.[8] İster değişen gen düzenlemesi ister bozulmuş protein sentezi yoluyla olsun, bu temel süreçlerdeki bozulmalar, patojenlere karşı sağlam bir savunma için gerekli olan bağışıklık aracıları, reseptörler ve enzimlerin üretimini etkileyebilir. Bu tür genetik etkiler, varyantlar tarafından bozulduğunda geniş hücresel mekanizmaların konakçının Clostridium difficile enfeksiyonlarını çözme kapasitesini nasıl etkileyebileceğini vurgulamaktadır.

Diğer varyantlar, hücre yapısında, mitokondriyal fonksiyonda ve epitel bütünlüğünde yer alan genleri etkiler ve bunların tümü bağırsak patojenlerine karşı konak savunmasıyla ilgilidir. rs13181507 varyantı, DAP-DT ve CTNND2 ile ilişkilidir; CTNND2 (delta-katenin), bağırsak bariyerinin bütünlüğünü korumak için çok önemli olan hücre adezyonunda ve sinyalizasyonda yer alır. RPL3P8 ve IMMP2L yakınındaki rs6948305 varyantları, sırasıyla ribozomal protein fonksiyonunu ve mitokondriyal metabolizmayı etkileyebilir, çünkü IMMP2L mitokondriyal protein işlemesinde yer alır. rs10927954 ile ilişkili bir gen olan KAZN, keratinosit farklılaşmasında ve hücre adezyonunda rol oynar ve bu da epitel bariyer fonksiyonuyla ilgili olabilir. Son olarak, rs4711277 ve rs494718 varyantlarına sahip olan LSM2, mRNA işlemesinde ve yıkımında yer alır.[9] Bozulmuş bir bağırsak bariyeri, bozulmuş hücresel enerji üretimi veya düzensiz gen ekspresyonu, C. difficilekolonizasyonuna ve enfeksiyon şiddetine karşı artan kırılganlığa katkıda bulunabilir.

RS IDGenİlişkili Özellikler
rs3134745 HLA-C - USP8P1LGMN/SPINT2 protein level ratio in blood
MMP9/PGLYRP1 protein level ratio in blood
CSF1/SEMA3F protein level ratio in blood
clostridium difficile infection
interleukin-5 receptor subunit alpha measurement
rs9271367
rs9271325
rs9270664
HLA-DRB1 - HLA-DQA1blood protein amount
CD74/TIMD4 protein level ratio in blood
clostridium difficile infection
staphylococcus seropositivity
rs114751021 DDX39B, SNORD117, ATP6V1G2-DDX39Bclostridium difficile infection
omega-6 polyunsaturated fatty acid measurement
linoleic acid measurement
rs117373257 CNOT4clostridium difficile infection
rs13181507 DAP-DT - CTNND2clostridium difficile infection
rs6948305 RPL3P8 - IMMP2Lclostridium difficile infection
rs140091914
rs707924
rs707926
VARS1clostridium difficile infection
rs9266276 HLA-Bsusceptibility to cold sores measurement
clostridium difficile infection
rs10927954 KAZNclostridium difficile infection
rs4711277
rs494718
LSM2clostridium difficile infection

Clostridium Difficile Enfeksiyonu Hakkında Sıkça Sorulan Sorular

Section titled “Clostridium Difficile Enfeksiyonu Hakkında Sıkça Sorulan Sorular”

Bu sorular, mevcut genetik araştırmalara dayanarak clostridium difficile enfeksiyonunun en önemli ve spesifik yönlerini ele almaktadır.


1. Neden ben C. diff kaptım da arkadaşım kapmadı, benzer antibiyotik kullanımına rağmen?

Section titled “1. Neden ben C. diff kaptım da arkadaşım kapmadı, benzer antibiyotik kullanımına rağmen?”

Benzer maruziyetlere rağmen, bireysel genetik farklılıklar bazı kişileri C. difficile gibi enfeksiyonlara karşı daha duyarlı hale getirebilir. Bu genetik varyasyonlar veya polimorfizmler, bağışıklık sisteminizin nasıl tepki verdiğini veya bağırsak mikrobiyomunuzun antibiyotik kullanımından sonra nasıl iyileştiğini etkileyebilir ve bu da enfeksiyonu geliştirme olasılığınızı artırabilir veya azaltabilir.

2. Eğer C. diff geçirdiysem, çocuklarımın da yakalanma olasılığı daha mı yüksek?

Section titled “2. Eğer C. diff geçirdiysem, çocuklarımın da yakalanma olasılığı daha mı yüksek?”

C. difficileenfeksiyonunun kendisi genetik bir hastalık gibi kalıtsal olmasa da, enfeksiyonlara duyarlılığı artıran belirli bağışıklık tepkilerine veya bağırsak sağlığı özelliklerine yatkınlık, ortak genetik faktörler nedeniyle ailelerde görülebilir. Ancak, antibiyotik kullanımı ve hastane ortamına maruz kalma gibi çevresel tetikleyiciler genellikle tek başına genetikten daha doğrudan nedenlerdir.

3. Tedaviden sonra bile neden C. diff enfeksiyonum tekrar tekrar geri geliyor?

Section titled “3. Tedaviden sonra bile neden C. diff enfeksiyonum tekrar tekrar geri geliyor?”

Tekrarlama inanılmaz derecede sinir bozucu olabilir. Sporların kalıcılığının ve bağırsak mikrobiyomunuzun tam olarak eski haline dönmemesinin ötesinde, bireysel genetik yapınız, bağışıklık sisteminizin enfeksiyonu ne kadar etkili bir şekilde temizlediğini veya bağırsak ortamınızın ne kadar çabuk yeniden dirençli hale geldiğini etkileyebilir. Bilim insanları aktif olarak bu konakçı genetik faktörlerini araştırmaktadır.

4. Etnik kökenim veya geçmişim C. diff için beni daha mı fazla risk altında bırakır?

Section titled “4. Etnik kökenim veya geçmişim C. diff için beni daha mı fazla risk altında bırakır?”

Olabilir. Birçok hastalık için genetik risk faktörleri, farklı etnik veya atalara ait gruplar arasında değişiklik gösterebilir.C. difficileiçin araştırmalar hala devam ederken, bağışıklık veya bağırsak sağlığı ile ilgili genlerdeki varyasyonlar bazı popülasyonlarda daha yaygın olabilir ve bu da duyarlılığı veya hastalık şiddetini potansiyel olarak etkileyebilir.

5. Bir DNA testi, şiddetli C. diff riski altında olup olmadığımı söyleyebilir mi?

Section titled “5. Bir DNA testi, şiddetli C. diff riski altında olup olmadığımı söyleyebilir mi?”

Henüz özellikle C. difficile için değil. Bazı durumlar için genetik testler mevcut olsa da, C. difficile duyarlılığı veya şiddeti için spesifik genetik belirteçlere yönelik araştırmalar hala erken aşamalarındadır. Bilim insanları bu varyasyonları belirlemek için çalışıyorlar, ancak bu, günümüzde C. difficile riski için standart, klinik olarak kullanılabilir bir test değildir.

6. Bazı insanlar neden C. diff ile diğerlerinden çok daha hasta oluyor?

Section titled “6. Bazı insanlar neden C. diff ile diğerlerinden çok daha hasta oluyor?”

C. difficile enfeksiyonunun şiddeti büyük ölçüde değişebilir. Spesifik bakteri türü ve genel sağlığınız gibi faktörler önemli bir rol oynasa da, bireysel genetik farklılıklar da vücudunuzun C. difficile tarafından üretilen toksinlere ne kadar yoğun tepki verdiğini etkileyebilir. Bu genetik varyasyonlar, bağışıklık yanıtınızı ve inflamasyon seviyelerinizi etkileyerek farklı sonuçlara yol açabilir.

7. Antibiyotik kullanımında bile genlerim beni C. difficile enfeksiyonundan koruyabilir mi?

Section titled “7. Antibiyotik kullanımında bile genlerim beni C. difficile enfeksiyonundan koruyabilir mi?”

Bazı insanların, C. difficile gibi enfeksiyonlara karşı bir dereceye kadar doğal koruma sağlayan genetik varyasyonlara sahip olması mümkündür. Bu, doğal olarak güçlü bir bağırsak mikrobiyomunu destekleyerek veya daha etkili bir bağışıklık tepkisi sağlayarak olabilir. Ancak, geniş spektrumlu antibiyotik kullanımı neredeyse herkes için önemli bir risk faktörü olmaya devam etmektedir.

8. Yaşım, C. difficile için genetik riskimi artırır mı?

Section titled “8. Yaşım, C. difficile için genetik riskimi artırır mı?”

İleri yaş, C. difficile enfeksiyonu ve daha şiddetli sonuçlar için bilinen bir risk faktörü olsa da, genellikle belirli yaşa bağlı genetik değişikliklerin doğrudan C. difficile için genetik riskinizi artırmasından ziyade, bağışıklık sisteminin genel olarak zayıflaması ve sağlık hizmetlerine maruz kalmanın artmasıyla daha fazla ilişkilidir. Genetik çalışmalar genellikle yaşı ayrı bir katkıda bulunan faktör olarak hesaba katar.

9. Kardeşimde şiddetli C. diff enfeksiyonu varsa, bende de şiddetli geçirme olasılığı daha mı yüksek?

Section titled “9. Kardeşimde şiddetli C. diff enfeksiyonu varsa, bende de şiddetli geçirme olasılığı daha mı yüksek?”

Kardeşiniz şiddetli bir vaka yaşadıysa, bağışıklık tepkinizi veya bağırsak sağlığınızı etkileyebilecek bazı temel genetik yatkınlıkları paylaşıyor olabilirsiniz. Ancak, benzersiz tıbbi geçmişiniz, antibiyotik maruziyetiniz ve bağırsak mikrobiyomunuzun mevcut durumu gibi diğer birçok faktör de bireysel riskinizi ve hastalık seyrinizi büyük ölçüde etkiler.

10. İyi hijyen ile C. diff’e karşı genetik yatkınlığın üstesinden gelebilir miyim?

Section titled “10. İyi hijyen ile C. diff’e karşı genetik yatkınlığın üstesinden gelebilir miyim?”

Kesinlikle. Genetik yatkınlık rol oynayabilse de, çevresel faktörler ve yaşam tarzı seçimleri güçlü etkenlerdir. Titiz hijyen (özellikle el yıkama), dikkatli antibiyotik kullanımı ve sağlıklı bir bağırsak mikrobiyomunu korumak, potansiyel genetik yatkınlıklardan bağımsız olarak, riskinizi önemli ölçüde azaltabilecek önemli eylemlerdir.


Bu SSS, güncel genetik araştırmalara dayanarak otomatik olarak oluşturulmuştur ve yeni bilgiler geldikçe güncellenebilir.

Sorumluluk Reddi: Bu bilgiler yalnızca eğitim amaçlıdır ve profesyonel tıbbi tavsiye yerine kullanılmamalıdır. Kişiselleştirilmiş tıbbi rehberlik için daima bir sağlık uzmanına danışın.

[1] DeLorenze, G. N. “Polymorphisms in HLA Class II Genes Are Associated With Susceptibility to Staphylococcus aureus Infection in a White Population.”J Infect Dis, 2015. PMID: 26450422.

[2] Johnson, E. O. “Novel Genetic Locus Implicated for HIV-1 Acquisition with Putative Regulatory Links to HIV Replication and Infectivity: A Genome-Wide Association Study.” PLoS One, 2015. PMID: 25786224.

[3] McLaren, P. J. “Association Study of Common Genetic Variants and HIV-1 Acquisition in 6,300 Infected Cases and 7,200 Controls.” PLoS Pathog, 2013. PMID: 23935489.

[4] Ye, Z. “Genome Wide Association Study of SNP-, Gene-, and Pathway-Based Approaches to Identify Genes Influencing Susceptibility to Staphylococcus Aureus Infections.” Front Genet, 2014. PMID: 24847357.

[5] Moore, C. B. “Phenome-wide Association Study Relating Pretreatment Laboratory Parameters With Human Genetic Variants in AIDS Clinical Trials Group Protocols.”Open Forum Infect Dis, 2015. PMID: 25884002.

[6] Jiang, D. K., et al. “Genetic variants in five novel loci including CFB and CD40 predispose to chronic hepatitis B.”Hepatology, vol. 62, no. 1, 2015, pp. 112-23.

[7] Pelak, K., et al. “Host determinants of HIV-1 control in African Americans.” J Infect Dis, vol. 201, no. 8, 2010, pp. 1143-51.

[8] Miki, D., et al. “HLA-DQB1*03 confers susceptibility to chronic hepatitis C in Japanese: a genome-wide association study.”PLoS One, vol. 8, no. 12, 2013, e84226.

[9] Chang, S. W., et al. “A genome-wide association study on chronic HBV infection and its clinical progression in male Han-Taiwanese.”PLoS One, vol. 9, no. 6, 2014, e94924.