İçeriğe geç

Bakteriyel Pnömoni

Bakteriyel pnömoni, bakteriyel patojenler nedeniyle akciğerin hava keseciklerinin (alveollerin) inflamasyonu ile karakterize akut bir solunum yolu enfeksiyonudur. Normalde oksijen alışverişinden sorumlu olan bu hava kesecikleri, sıvı ve irinle dolarak öksürük, ateş, nefes darlığı ve göğüs ağrısı gibi semptomlara yol açar. Çeşitli mikroorganizmalar pnömoniye neden olabilse de, bakteriyel formlar yaygın ve önemli bir klinik endişe kaynağıdır.

Bakteriyel pnömoninin biyolojik temeli, istilacı bakterilere karşı konakçı immün yanıtını içerir. Bakteriler solunum yolunu başarıyla kolonize edip yerel savunmaları aştığında, bir inflamatuar kaskadı tetiklerler. Bireysel bakteriyel pnömoni duyarlılığı, hastalığın şiddeti ve sonucu, konakçı genetik faktörlerinden etkilenebilir. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), pnömoni de dahil olmak üzere bakteriyel enfeksiyonlara duyarlılıkla ilişkili çeşitli genetik lokusları ve varyantları tanımlamıştır[1]. Örneğin, araştırmalar β-globin lokusundaki spesifik varyantları Afrika kökenli Amerikalı çocuklarda pnömoni ile ilişkilendirmiştir [2]. Diğer çalışmalar, pnömoni duyarlılığının genetik mimarisini daha da aydınlatmış, çeşitli yolları işaret ederek ve spesifik genomik bölgelerle düşündürücü ilişkilendirmeler tanımlamıştır [3], [4].

Klinik olarak, bakteriyel pnömoni dünya genelinde hastaneye yatış ve ölümlerin önde gelen nedenlerinden biridir; özellikle yaşlılar, küçük çocuklar ve bağışıklık sistemi zayıflamış veya altta yatan sağlık sorunları olan bireyler gibi savunmasız popülasyonlar arasında. Genellikle göğüs görüntüleme ve mikrobiyolojik testleri içeren hızlı tanı, tipik olarak antibiyotiklere dayanan etkili tedavi için hayati öneme sahiptir. Bakteriyel pnömoniye genetik yatkınlıkları anlamak, yüksek risk altındaki bireylerin belirlenmesine yardımcı olabilir, potansiyel olarak daha hedefe yönelik önleme stratejilerine ve kişiselleştirilmiş tedavi yaklaşımlarına yol açabilir.

Toplumsal bir bakış açısıyla, bakteriyel pnömoni önemli bir halk sağlığı yükü oluşturmaktadır. Sağlık hizmetleri maliyetlerine, üretkenlik kaybına ve küresel morbidite ve mortalite oranlarına önemli ölçüde katkıda bulunur. Halk sağlığı girişimleri, yaygın bakteriyel patojenlere (örn.Streptococcus pneumoniae) karşı aşılamaya ve bulaşmayı azaltmak için hijyeni teşvik etmeye odaklanmaktadır. Duyarlılığı ve direnci etkileyen genetik faktörlere yönelik araştırmalar, yeni tanı yöntemleri, tedaviler ve önleyici tedbirler geliştirme yolları sunarak, bu yaygın enfeksiyonun genel toplumsal etkisini azaltmaktadır.

Bakteriyel pnömoninin genetik temellerini anlamak karmaşıktır ve mevcut araştırma metodolojilerindeki ve çalışma tasarımlarındaki çeşitli sınırlamalar dikkate alınmayı gerektirmektedir. Bu faktörler, bulguların yorumlanmasını ve genellenebilirliğini etkileyebilir, gelecekteki araştırmalar için alanları vurgulamaktadır.

Çalışma Tasarımı ve İstatistiksel Güç

Section titled “Çalışma Tasarımı ve İstatistiksel Güç”

Bakteriyel pnömoni üzerine yapılan güncel araştırmalar, istatistiksel güç ve çalışma tasarımıyla ilgili zorluklarla sıkça karşılaşmakta olup, bu durum tanımlanan genetik ilişkilendirmelerin sağlamlığını etkileyebilir. Pnömoni için gözlemlenen düşük SNP kalıtılabilirliği, genetik mimarisinin önemli bir kısmının açıklanamadığını düşündürmektedir; bu durum muhtemelen yetersiz örneklem büyüklüklerinden veya karmaşık gen-çevre etkileşimlerinin varlığından kaynaklanmaktadır[3]. Bu düşük kalıtılabilirlik, zayıf ilişkilendirmelere sahip varyantları tespit etme gücünün azalmasıyla birleştiğinde, pnömoni yatkınlığını etkileyen bazı genetik faktörlerin gözden kaçırılabileceği anlamına gelmekte, bu da bozukluğun genetik manzarasını tam olarak çözümlemeyi zorlaştırmaktadır [2]. Ayrıca, bazı çalışmalarda görüldüğü gibi, bağımsız kohortlarda veya farklı fenotipleme yaklaşımlarında genom çapında anlamlı SNP’ler için replikasyon eksikliği gibi sorunlar, ilk bulguları doğrulamak için daha büyük ve daha çeşitli doğrulama çabalarına duyulan ihtiyacın altını çizmektedir [3].

Kohort seçim yanlılıkları, sonuçların güvenilirliğini ve genellenebilirliğini etkileyen karıştırıcı faktörleri de beraberinde getirebilir. Örneğin, belirli topluluklardan etkilenen çocukları, elektif cerrahi geçiren yetişkin kontrol bireyleriyle karşılaştıran çalışmalar, genetik soy için düzeltme çabalarına rağmen yaş ve sağlık durumu farklılıklarını ortaya çıkarabilir [2]. Ek olarak, genel popülasyona kıyasla astım veya kronik akciğer hastalığı gibi komorbid durumların daha yüksek prevalansına sahip kontrol popülasyonları, gerçek ilişkilendirmeleri maskeleyebilir veya yanıltıcı bulgulara yol açabilir[2]. Bazı kohortlardaki kontrol gruplarının daha önce pnömoni geçirmiş olma potansiyeli, vakalar ve kontroller arasındaki ayrımı bulanıklaştırdığı ve incelenen genetik sinyalleri seyreltebileceği için istatistiksel gücü daha da azaltır [3].

Fenotipik Heterojenite ve Ölçüm Zorlukları

Section titled “Fenotipik Heterojenite ve Ölçüm Zorlukları”

Bakteriyel pnömoninin tanımlanması ve saptanması, genetik analizleri karmaşık hale getirebilecek fenotipik heterojeniteye katkıda bulunan önemli zorluklar teşkil etmektedir. Pnömoni, çeşitli faktörlerden kaynaklanan geniş bir durumdur ve vakalar teşhis edilmeden kalabilir; bu da genetik çalışmalarda fenotipi kesin olarak karakterize etmeyi zorlaştırmaktadır [3]. Bu heterojenite, yalnızca yatkınlığa odaklanan bir genom çapında ilişkilendirme çalışmasının (GWAS), pnömoni şiddetini araştıran bir çalışmadan farklı biyolojik içgörüler sağlayabileceği ve daha ayrıntılı ve katmanlı fenotiplemeyi gerektirdiği anlamına gelir. Örneğin, yaşlı popülasyonlarda pnömoninin daha yüksek prevalansı göz önüne alındığında, yaşa göre katmanlara ayrılmış analizler kritik olabilir [3].

Çalışmalar arasında pnömoninin nasıl saptandığına dair farklılıklar, genetik bulguların tutarlılığını ve yorumlanabilirliğini de etkilemektedir. Kendi bildirdiği pnömoni veya faturalandırma kodları aracılığıyla klinik olarak saptanmış tanılar gibi yöntemlere güvenmek, tutarsızlıklar yaratabilir. Kendi bildirdiği veriler klinik doğrulamadan yoksun olabilirken, faturalandırma kodları tüm ilgili tanısal detayları yakalayamayabilir veya belirli pnömoni etiyolojileri arasında ayrım yapamayabilir [3]. Bu farklı saptama yaklaşımları, gözlemlenen heterojeniteye katkıda bulunabilir ve tutarlı genetik varyantları saptama gücünü azaltabilir; bu da pnömoninin genetik mimarisinin çözünürlüğünü artırmak için standartlaştırılmış ve kapsamlı fenotipleme protokollerine duyulan ihtiyacı vurgulamaktadır [3].

Pnömoninin mevcut genetik çalışmalarında önemli bir sınırlama, Avrupa kökenli popülasyonlara ağırlıklı olarak dayanılmasıdır. Bu odaklanma, genetik mimariler ve allel frekansları farklı popülasyonlar arasında önemli ölçüde değişebildiğinden, genetik sinyallerin taşınabilirliği ve bulguların diğer soy gruplarına genellenebilirliği hakkında endişelere yol açmaktadır [3]. Gelecekteki araştırma çabaları, sadece bulguların genellenebilirliğini iyileştirmekle kalmayıp, aynı zamanda popülasyonlar arası bağlantı dengesizliği modellerindeki farklılıklardan yararlanarak nedensel varyantların ince haritalanmasında avantajlar sunan trans-soy verileri toplamak için kritik öneme sahiptir [3].

Pnömoni için gözlemlenen nispeten düşük SNP kalıtım derecesi, genetik varyansının önemli bir kısmının açıklanamadığını ayrıca göstermektedir. Bu “eksik kalıtım derecesi”, mevcut GWAS’ların pnömoni yatkınlığında önemli bir rol oynayabilecek nadir varyantlar, yapısal varyasyonlar veya karmaşık gen-çevre etkileşimleri gibi tüm ilgili genetik faktörleri tam olarak yakalayamayabileceğini düşündürmektedir [3]. Sonuç olarak, tanımlanan genetik lokuslar değerli bilgiler sağlasa da, genel genetik yatkınlığın sadece bir kısmını temsil etmektedirler; bu da, pnömoninin konak-genetik mimarisini tam olarak açıklamak için yeni genetik mekanizmalar ve çevresel etkiler üzerine sürekli araştırmaya duyulan ihtiyacın altını çizmektedir.

Genetik varyasyonlar, bir bireyin bakteriyel pnömoniye yatkınlığında önemli bir rol oynamakta; immün yanıttan akciğer dokusu bütünlüğüne ve hatta davranışsal kalıplara kadar bir dizi biyolojik süreci etkilemektedir. Çeşitli genlerde birden fazla tek nükleotid polimorfizmi (SNP) tanımlanmış olup, bu yaygın enfeksiyöz hastalığın altında yatan karmaşık genetik mimariyi vurgulamaktadır.

Dikkate değer varyantlardan biri olan, CHRNA3 geninin yakınında bulunan rs77438700 , bakteriyel pnömoni ile güçlü bir şekilde ilişkilendirilmiştir. Hastalığın başlangıcı tipik olarak 14 gün içinde ortaya çıkan semptomlarla karakterizedir[2]. Kesin bir tanısal kriter, bir radyolog tarafından doğrulanan, göğüs röntgeninde yeni bir infiltrasyonun varlığını içerir [2]. Bu radyolojik bulgularla birlikte, pnömoniyi düşündüren klinik özellikler de mevcut olmalıdır [2]. Bu özellikler aşağıdakilerden en az ikisini içerir: taşipne (yaşa göre ortalamadan iki standart sapmayı aşan solunum hızı), dispne, hipoksemi (bilinen bir karışık kalp lezyonu olmaksızın oda havasında %94’ün altında nabız oksimetrisi), kalıcı öksürük veya akciğer oskültasyonunda anormal bulgular [2].

Daha ileri operasyonel tanımlar, hastaların bu ek kriterlerden en az birini sergilemesini gerektirir: 36°C’nin altında (şok geçiren bireylerde) veya 38.5°C ve üzerinde ateş, 4.500/mL’nin altında veya 10.000/mL ve üzerinde periferik beyaz kan hücresi sayısı veya %15 veya daha fazla olgunlaşmamış nötrofil varlığı[2]. Araştırma amaçları için, vaka bireyler, özellikle radyografik olarak doğrulanmış yeni infiltrasyonlar dahil olmak üzere, bu kapsamlı klinik tanımı karşılamaları temelinde seçilir [2]. Kontrol bireyler ise, Michigan Üniversitesi MGI gibi biyobankalardan tipik olarak seçilir; bunlar, elektif prosedürler geçiren ve etkilenen popülasyonla benzer bir genetik soy dağılımına sahip olduklarından emin olmak için taranan bireylerden oluşur [2].

RS IDGenİlişkili Özellikler
rs763947133 FBN2Bakteriyel Pnömoni
rs374402947 CBFA2T3 - ACSF3Bakteriyel Pnömoni
rs532298826 RPS23P2 - PCDH18Bakteriyel Pnömoni
rs77438700 CHRNA3Bakteriyel Pnömoni
rs12670592 SDK1Bakteriyel Pnömoni
rs150968777 NR3C1 - RNU7-156PBakteriyel Pnömoni

Sınıflandırma Sistemleri ve Şiddet Dereceleri

Section titled “Sınıflandırma Sistemleri ve Şiddet Dereceleri”

Pnömoni, toplum kaynaklı pnömoni [2] gibi edinilme bağlamına göre sınıflandırılabilir. Bunun ötesinde, hastalığı kategorize etmek için, spesifik etken maddeler veya COVID-19 ile ilişkili pnömoni [5]gibi klinik sunumlarla ilişkili olanlar dahil, farklı sınıflandırma sistemleri mevcuttur. Şiddet derecelendirmeleri, klinik yönetim ve araştırmalar için çok önemlidir ve hastaları sıklıkla hafif, orta ve şiddetli hastalık durumları olarak kategorize eder[5]. Örneğin, COVID-19 ile ilişkili pnömonide, şiddetli bir hastalık grubu yaygın akciğer tutulumu (%50’nin üzerinde) veya %94’ün altında kan oksijen seviyesi ile tanımlanabilir[5].

Bu şiddet ayrımları, pnömonili hastaların (şiddetli ve orta vakaları içeren) pnömonisi olmayanlarla (hafif hastalık grubu) karşılaştırıldığı karşılaştırmalı çalışmalarda sıklıkla kullanılır[5]. Fenotipleme yaklaşımları da değişebilir; kendi bildirdiği pnömoni fenotiplerini veya ICD-10 tanıları gibi standartlaştırılmış tanı kodlarından türetilenleri kapsayabilir [3]. Pnömoni tanımında heterojenitenin mevcut olduğu, kısmen çeşitli faktörlerden kaynaklandığı ve bazen teşhis edilemeyebileceği kabul edilmektedir, bu da nosolojik sınıflandırmasındaki karmaşıklığı vurgulamaktadır [3].

Terminoloji, Nomenklatür ve İlgili Kavramlar

Section titled “Terminoloji, Nomenklatür ve İlgili Kavramlar”

Çekirdek terminoloji ‘pnömoni’ etrafında döner; ‘bakteriyel pnömoni’ ve ‘toplum kaynaklı pnömoni’ gibi alt tipler etiyolojiyi veya edinme ortamını belirtir[2]. Sıkça karşılaşılan ilgili klinik kavramlar arasında takipne, dispne, hipoksemi, öksürük ve akciğer oskültasyonu bulguları yer alır [2]. ‘Akciğer grafisi’ ve ‘infiltrat’ gibi tanısal görüntüleme terimleri temeldir [2]. Kandaki C-reaktif protein (CRP) ve Gama glutamil-transferaz (GGT) düzeyleri gibi biyokimyasal belirteçler, pnömoni için potansiyel risk faktörleri olarak tanımlanmıştır [3].

Genetik çalışmalarda, genetik yatkınlığı ölçmek için ‘genom çapında pnömoni poligenik risk skoru (PRS)’ gibi terimler kullanılır [3]. Komorbid durumlar da pnömoni bağlamında önemlidir; orak hücre hastalığı, nörolojik bozukluklar, astım, prematürite ve kronik akciğer hastalığı gibi örnekler genellikle tıbbi kayıt incelemesi veya belirli ICD-9 kodları aracılığıyla tanımlanır[2]. Ayrıca, araştırmalar pnömoni yatkınlığı ile depresyon gibi duygusal fenotipler arasında karmaşık, çift yönlü ilişkiler olduğunu ortaya koyarak, fiziksel ve zihinsel sağlık arasındaki girift etkileşimi vurgulamaktadır [3].

Temel Klinik Belirtiler ve Objektif Ölçümler

Section titled “Temel Klinik Belirtiler ve Objektif Ölçümler”

Bakteriyel pnömoni, objektif olarak ölçülebilen bir dizi solunum semptomuyla tipik olarak ortaya çıkar[2]. Başlıca klinik özellikler arasında, yaşa göre ortalamadan iki standart sapmadan daha fazla solunum hızı olarak tanımlanan takipne ve dispne yer alır [2]. İlk değerlendirme sırasında oda havasında %94’ün altında nabız oksimetrisi okumalarıyla saptanan hipoksemi, başka önemli bir göstergedir [2]. İnatçı öksürük ve akciğer oskültasyonunda anormal bulgular, sıklıkla bir radyolog tarafından doğrulanan göğüs radyografisinde yeni bir infiltratın varlığıyla birlikte, klinik tabloya daha da katkıda bulunur [2].

Sistemik Göstergeler ve Laboratuvar Bulguları

Section titled “Sistemik Göstergeler ve Laboratuvar Bulguları”

Doğrudan solunum belirtilerinin ötesinde, bakteriyel pnömoni sıklıkla tanı ve şiddet değerlendirmesi için kritik olan sistemik yanıtları tetikler[2]. Hastalar, 38.5°C veya üzerinde bir sıcaklıkla ateş gösterebilir; ancak şok geçiren bireylerde hipotermi (36°C veya altında sıcaklık) meydana gelebilir [2]. Laboratuvar değerlendirmeleri sıklıkla periferik beyaz kan hücresi sayımlarında 4,500/mL’nin altında veya 10,000/mL’nin üzerinde değişiklikler ya da %15 veya daha fazla immatür nötrofil varlığını ortaya koyar[2]. Bu objektif ölçümler, klinik semptomlar ve radyografik kanıtlarla birlikte değerlendirildiğinde, pnömoni tanısını doğrulamak için ayrılmaz bir parçadır [2].

Bakteriyel pnömoninin klinik sunumu, bireysel faktörlerden etkilenerek oldukça değişken olabilir ve tanısal karmaşıklıklara yol açar [3]. Örneğin, pnömoni yaşlılarda daha yaygın olarak görülmekte olup, yaşa bağlı yatkınlık ve klinik sunum farklılıklarını düşündürmektedir [3]. Spesifik tanı kodlarına dayalı fenotipik tanımlar, tanısal duyarlılığı ve özgüllüğü artırdığı kabul edilmekle birlikte, bir hekimin tanısı klinik sendromu tam olarak tanımlamadığında yanlış sınıflandırmalar meydana gelebilir [1]. Pnömoninin teşhis edilemeyebileceği durumlar da dahil olmak üzere bu tür heterojenite, pnömokokların doğru tanımlanması için ayrıntılı fenotipleme ile moleküler tanı yöntemleri veya kültür kullanımının önemini vurgulamaktadır [3]. Bu değişkenlik, özellikle ICD-10 kodlarındaki potansiyel örtüşmeler göz önüne alındığında, bakteriyel pnömoniyi diğer solunum yolu enfeksiyonlarından ayırmanın zorluğunu ortaya koymaktadır [1].

Bakteriyel pnömoni, akciğerin akut bir enfeksiyonu olup, sıvı dolu alveollere ve kısıtlı oksijen alımına yol açar. Bakteriyel enfeksiyon birincil bir neden olmakla birlikte, konak genetiği, çevresel maruziyetler ve bireysel sağlık faktörlerinin karmaşık etkileşimi, bir bireyin yatkınlığına ve hastalığın şiddetine önemli ölçüde katkıda bulunur[3].

Genetik Yatkınlık ve Konak Bağışıklığı

Section titled “Genetik Yatkınlık ve Konak Bağışıklığı”

Genetik faktörler, bir bireyin pnömoniye yatkınlığını belirlemede kritik bir rol oynamaktadır. Çalışmalar, pnömoni için bir poligenik risk skoru tanımlamış olup, birçok yaygın genetik varyantın toplu olarak bir bireyin riskini etkilediğini göstermektedir [3]. Örneğin, β-globin lokusundaki varyantlar, Afrika kökenli Amerikalı çocuklarda pnömoni ile ilişkilendirilmiş ve spesifik kalıtsal yatkınlıkları düşündürmektedir [2]. Pnömoni yatkınlığının genetik mimarisi, müsin biyolojisini ve aldosteron tarafından düzenlenen sodyum geri emilimi gibi yolları da içermektedir; akciğerdeki NPIPB7 ve dalaktaki SULT1A1 gibi genlerin değişmiş ekspresyonu artan riskle ilişkilendirilmiştir[3]. Ayrıca, nadir varyantlar ve MHC bölgesi de dahil olmak üzere spesifik lokuslar da yatkınlığa katkıda bulunmaktadır; ancak MHC varyantlarının fonksiyonel yorumlanması, bireyin HLA tipi gibi yerel genomik bağlamının dikkate alınmasını gerektirir [3].

Çevresel Tetikleyiciler ve Gen-Çevre Etkileşimleri

Section titled “Çevresel Tetikleyiciler ve Gen-Çevre Etkileşimleri”

Çevresel faktörler, özellikle patojenlere maruz kalma, bakteriyel pnömoni için doğrudan tetikleyicilerdir. Bakteriyel ve viral enfeksiyonlar, karakteristik akciğer enflamasyonuna yol açan en yaygın etiyolojilerdir[3]. Genetik riskin etkisi, farklı popülasyonlar ve coğrafi bölgeler arasında değişebilir; bu da konakçı-genetik etkileri tam olarak anlamak için trans-soysal çalışmaların önemini vurgulamaktadır [3]. Sosyoekonomik faktörler, patojenlere maruz kalmayı ve sağlık hizmetlerine erişimi dolaylı olarak etkileyerek, pnömoni geliştirme riskini daha da modüle edebilir. Spesifik genler ile çevresel tetikleyiciler arasındaki doğrudan etkileşim karmaşık olsa da, bir bireyin zayıflamış bir bağışıklık yanıtına veya değişmiş akciğer fizyolojisine genetik yatkınlığının, bakteriyel patojenlere maruz kaldığında hassasiyetini artırabildiği bilinmektedir.

Komorbiditeler, Yaş ve Gelişimsel Faktörler

Section titled “Komorbiditeler, Yaş ve Gelişimsel Faktörler”

Diğer bireysel faktörler, bakteriyel pnömoni riskini ve şiddetini önemli ölçüde artırır. Nörolojik bozukluklar, nöbetler, gelişimsel gecikmeler, astım ve kronik akciğer hastalığı gibi komorbid durumlar, pnömoniden etkilenen bireylerde sıklıkla gözlenmektedir[2]. Bu önceden var olan sağlık sorunları, solunum fonksiyonunu veya bağışıklık yanıtını tehlikeye atarak bireyleri enfeksiyona ve ciddi sonuçlara karşı daha duyarlı hale getirebilir. Yaş, pnömoninin yaşlı popülasyonda daha yaygın ve genellikle daha şiddetli olmasıyla birlikte başka bir kritik belirleyicidir [3]. Gelişimsel etkiler, özellikle erken yaşamda, farklı topluluklardaki çocuklarda pnömoniyi inceleyen çalışmalarla kanıtlandığı üzere, bir bireyin solunum yolu enfeksiyonlarına karşı uzun vadeli duyarlılığını da şekillendirebilir [2].

Bakteriyel pnömoni, gaz alışverişinden sorumlu küçük hava kesecikleri olan alveollerde iltihaplanma ve sıvı birikimi ile karakterize, akciğerlerin akut bir enfeksiyonudur. Bu sıvı birikimi, oksijen alımını kısıtlayarak bozulmuş solunum fonksiyonuna yol açar ve patofizyolojisinin önemli bir ayırt edici özelliği olarak hizmet eder[3]. Pnömoni çeşitli patojenlerden kaynaklanabilse de, bakteriyel enfeksiyonlar yaygın bir etiyolojidir ve iyileşme için antibiyotik tedavisini gerektirir [3]. Tıbbi bakımdaki gelişmelere rağmen, pnömoni sürekli yüksek ölüm oranları ile önemli bir küresel sağlık sorunu olmaya devam etmekte, konak duyarlılığı ve hastalık mekanizmalarına dair daha derinlemesine bir anlayışa duyulan ihtiyacın altını çizmektedir[3].

Konak İmmün Yanıtları ve Moleküler Savunma Yolları

Section titled “Konak İmmün Yanıtları ve Moleküler Savunma Yolları”

Vücudun bakteriyel pnömoniye karşı savunması, konak immün yanıtları ve moleküler yolların karmaşık bir etkileşimini içerir. Bu mekanizmalar, genel savunma yanıtlarının yanı sıra, inflamatuar ve immün efektör süreçlerin karmaşık düzenlenmesini kapsar [6]. Makrofajlar, doğal öldürücü hücreler ve doğuştan lenfoid hücreler gibi kritik immün hücreler, akciğer dokularındaki bakteriyel patojenlerin tanımlanması ve elimine edilmesi için hayati öneme sahiptir [6]. Bu hücresel koordinasyon, genellikle sitokin-sitokin reseptör etkileşimleri aracılığıyla sağlanır ve bu etkileşimler, immün sistemin enfeksiyona yanıtını düzenlemede merkezi bir role sahiptir[6]. C-reaktif protein (CRP) gibi temel biyomoleküller, inflamasyon göstergeleri olarak hizmet eder ve çalışmalar, pnömoni yatkınlığı üzerindeki nedensel etkilerini tahmin etmektedir [3]. Ayrıca, tümör nekroz faktörü-alfa (TNF-alfa) biyolojisi, reseptörü olan TNFRSF1A’in diğer inflamatuar durumlarla ilişkisi nedeniyle, daha fazla araştırma için bir aday olarak kabul edilmekte ve akciğer enfeksiyonu yanıtlarındaki potansiyel rolünü düşündürmektedir [3]. Araştırmalar ayrıca, çeşitli patojenlerin neden olduğu invaziv bakteriyel hastalıklara yatkınlığın altında yatan ortak bir genetik mimariyi göstermekte, bu da ortak konak savunma mekanizmalarına işaret etmektedir [7].

Duyarlılığın Genetik Mimarisi ve Düzenleyici Mekanizmaları

Section titled “Duyarlılığın Genetik Mimarisi ve Düzenleyici Mekanizmaları”

Konak genetik faktörleri, bir bireyin pnömoniye duyarlılığını belirlemede önemli bir rol oynamaktadır; enfeksiyöz hastalıklara bağlı ölümlerin kalıtılabilirliği için tahminler %40’a ulaşmaktadır [3]. Genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), pnömoni duyarlılığı ile ilişkili çok sayıda genetik varyasyon tanımlamış ve genom çapında bir pnömoni poligenik risk skoruna katkıda bulunmuştur [3]. Bu genetik bulgular, müsin biyolojisi ve aldosteron tarafından düzenlenen sodyum geri emilimi dahil olmak üzere belirli biyolojik yolları, pnömoni duyarlılığını anlamada potansiyel eyleme geçirilebilir hedefler olarak vurgulamıştır[3]. İlişkili diğer yollar arasında kalp kapağı gelişimi, kollajen biyosentez süreçleri ve pozitif timik T hücre seçimi ile ilgili olanlar yer almaktadır; bu da konak savunması ve doku bütünlüğü üzerinde geniş genetik etkiler düşündürmektedir [3].

Transkriptom çapında ilişkilendirme çalışmaları (TWAS), tahmini ekspresyon seviyelerinin pnömoni duyarlılığı ile ilişkili olduğu belirli genleri daha da aydınlatmıştır. Örneğin, akciğer dokusunda NPIPB7’nin ve dalakta SULT1A1’in tahmini ekspresyonunun azalması, tüm kanda PSMA4’ün yukarı regüle edilmiş tahmini ekspresyonu ile birlikte, pnömoni riskinin artmasıyla ilişkilendirilmiştir [3]. Ek olarak, β-globin lokusundaki varyantlar pnömoni duyarlılığı ile ilişkilendirilmiştir, özellikle Afro-Amerikan çocuklarda gözlemlenmiştir [2]. BIRC6geni de çocuklarda invaziv bakteriyel enfeksiyon riskini değiştirmedeki rolü nedeniyle tanımlanmış, bu da daha geniş bakteriyel hastalık duyarlılığına olan önemini vurgulamıştır[7]. Mycobacterium tuberculosis enfeksiyonuna direnç üzerine yapılan çalışmalar, belirli genetik lokusların belirli bakteriyel patojenlere karşı nasıl konak savunması sağlayabileceğini daha da göstermektedir [8].

Organa Özgü Etkiler ve Sistemik Etkileşimler

Section titled “Organa Özgü Etkiler ve Sistemik Etkileşimler”

Pnömonide akciğer birincil enfeksiyon bölgesi olsa da, hastalığın biyolojik sonuçları sistemik olarak yayılarak diğer dokuları ve organ sistemlerini etkiler. Hastalık, akciğer, tam kan ve dalak içinde karmaşık doku etkileşimlerini içerir; bu bölgelerde belirli gen ekspresyonu paternleri yatkınlıkla ilişkilidir[3]. Akciğer ve gastrointestinal hastalıklar arasında ortak bir genetik mimarinin olduğuna dair kanıtlar da bulunmaktadır; bu durum, altta yatan sistemik bağlantıları ve düzenleyici etkileri düşündürmektedir[6]. Bu birbirine bağlılık, bağırsak-akciğer ekseninin potansiyel önemine işaret etmektedir; burada D vitamini reseptöründeki varyasyonlar gibi konak faktörleri, bağırsak mikrobiyotasını etkileyebilir ve bu da genel immün fonksiyonu ile solunum yolu enfeksiyonlarına yatkınlığı etkileyebilir [9].

Komorbid durumlar, pnömoninin klinik tablosunu ve ilerleyişini önemli ölçüde etkileyebilir. Pnömoniden etkilenen bireylerde nöbetler veya gelişimsel gecikme gibi nörolojik bozukluklar da görülebilir [2]. Ayrıca, astım ve kronik akciğer hastalığı gibi önceden var olan durumlar, bir bireyin pnömoniye yatkınlığını değiştirebilir veya klinik seyrini modifiye edebilir[2]. Akciğerlerde başlayan sistemik enflamatuar yanıt, bu nedenle yaygın etkilere yol açarak, birincil enfeksiyon bölgesinin ötesinde vücut genelindeki çeşitli fizyolojik süreçleri etkileyebilir.

Bakteriyel pnömoni, konak genetiği, immün yanıtlar ve mikrobiyom dahil olmak üzere çevresel faktörler arasında karmaşık etkileşimler içerir; bunlar toplu olarak yatkınlığı ve hastalık seyrini belirler. Araştırmalar, akciğerlerdeki bakteriyel enfeksiyonlara karşı konağın savunmasına veya duyarlılığına katkıda bulunan birkaç temel yolak ve mekanizmayı vurgulamaktadır.

Konak Genetik Faktörleri ve İmmün Sinyalleşme

Section titled “Konak Genetik Faktörleri ve İmmün Sinyalleşme”

Konak genetik mimarisi, kritik immün sinyal yollarını etkileyerek, bakteriyel pnömoni dahil olmak üzere bir bireyin çeşitli enfeksiyonlara yatkınlığında önemli bir rol oynar. Çalışmalar, genel enfeksiyon yatkınlığı ile ilişkili genetik lokuslar tanımlamış, bu da immün reseptörleri veya sinyal moleküllerini kodlayan genlerdeki varyasyonların, konağın etkili bir savunma oluşturma yeteneğini değiştirebileceğini göstermektedir[10]. Örneğin, inflamatuar yanıtların düzenlenmesi, immün yanıtın moleküler medyatörlerinin üretimi ve lökosit aktivasyonu, karmaşık hücre içi sinyal kaskatları ve transkripsiyon faktörü regülasyonu tarafından sıkı bir şekilde kontrol edilir; burada genetik varyasyonlar yol disregülasyonuna yol açabilir [6]. Bu mekanizmalar, uygun immün hücre toplanmasını ve patojen temizliğini başlatmak için kritik öneme sahiptir ve bunların işlev bozukluğu, bakteriyel patojenlere karşı savunmasızlığı artırabilir.

Musin Biyolojisi ve Epitelyal Bariyer Fonksiyonu

Section titled “Musin Biyolojisi ve Epitelyal Bariyer Fonksiyonu”

Epitelyal bariyerin, özellikle solunum yolundaki bütünlüğü ve işlevi, bakteriyel istilaya karşı kritik ilk savunma hatlarıdır. Pnömoni duyarlılığının genetik mimarisi, musin biyolojisi ile doğrudan ilişkilendirilmiştir; bu da musin üretimi veya bileşimi ile ilgili genlerdeki varyasyonların bu bariyeri etkilediğini düşündürmektedir [3]. Musinler, patojenleri tuzağa düşürüp temizlenmelerini kolaylaştıran, koruyucu bir mukus tabakası oluşturan yoğun glikozillenmiş proteinlerdir. Musin gen ekspresyonundaki veya post-translasyonel modifikasyondaki disregülasyon, bu fiziksel bariyeri tehlikeye atarak konağı bakteriyel yapışmaya ve ardından gelen enfeksiyona karşı daha duyarlı hale getirebilir.

Mikrobiyom-Konak Etkileşimleri ve Metabolik Regülasyon

Section titled “Mikrobiyom-Konak Etkileşimleri ve Metabolik Regülasyon”

İnsan bağırsak mikrobiyomu, konak bağışıklığını ve metabolizmasını önemli ölçüde etkileyerek, akciğer enfeksiyonlarına karşı duyarlılığı etkileyebilen karmaşık bir ağ oluşturur. Konak genetik faktörleri, Vitamin D reseptöründeki (VDR) varyasyon gibi, bağırsak mikrobiyotasının bileşimini ve çeşitliliğini etkiler[9]. Bu etkileşim, konak genetik yatkınlıklarının mikrobiyal ortamı şekillendirebildiği, bunun da sırayla sistemik immün yanıtları ve metabolik yolları modüle ettiği bir düzenleyici mekanizmayı işaret eder. Bağırsak mikrobiyotası ile konak fizyolojisi arasındaki çapraz konuşma, immün efektör süreçlerinin ve inflamatuar yanıtların düzenlenmesi dahil olmak üzere, bu nedenle konağın bakteriyel pnömoniye karşı direnme yeteneğini dolaylı olarak etkileyebilir [11].

Pnömoni duyarlılığı izole bir fenomen değil, aksine farklı organ sistemleri arasında kapsamlı yol çapraz konuşması içeren entegre biyolojik ağların ortaya çıkan bir özelliğidir. Akciğer ve gastrointestinal hastalıklar arasında ortak bir genetik mimari karakterize edilmiş olup, immün ve inflamatuar regülasyonun sistemik doğasını vurgulamaktadır[6]. Bu sistem düzeyinde entegrasyon, genel immün yanıtları, immünoglobulin üretimini ve hücre aktivasyonunu yöneten yollardaki düzensizliğin birden fazla organ sistemi üzerinde nasıl geniş kapsamlı etkilere sahip olabileceğini göstermektedir. Bu ağ etkileşimlerini ve hiyerarşik regülasyonu anlamak, sistemik kompanzatuvar mekanizmalardan yararlanarak bakteriyel pnömoniye karşı konak yanıtlarını modüle edebilecek potansiyel terapötik hedefleri belirlemek için esastır.

Bakteriyel pnömoni üzerine yapılan popülasyon çalışmaları, hastalığın prevalansı, insidansı ve duyarlılığı etkileyen genetik, demografik ve çevresel faktörlerin karmaşık etkileşimi hakkında önemli bilgiler sunar. Bu araştırmalar genellikle geniş ölçekli kohortları, farklı popülasyonları ve hastalığın altında yatan mekanizmalarını ortaya çıkarmak için gelişmiş genomik metodolojileri içerir.

Epidemiyolojik Kalıplar ve Geniş Genetik Duyarlılık

Section titled “Epidemiyolojik Kalıplar ve Geniş Genetik Duyarlılık”

Büyük ölçekli popülasyon çalışmaları, bakteriyel pnömoni ve ilişkili enfeksiyonların prevalans ve insidans kalıplarını, ayrıca bunların altında yatan genetik risk faktörlerini aydınlatmaktadır. Bir genom çapında meta-analiz, yaygın insan enfeksiyon hastalıkları riskini tanımlamış, farklı popülasyon çeyreklerinde tekrarlayan pnömoni vakalarının ve genel bakteriyel enfeksiyonların belirli yüzdelerini kaydetmiştir. Genellikle büyük popülasyon kohortlarından yararlanan bu kapsamlı çalışmalar, duyarlılığın genetik temellerini ortaya çıkarmak için genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) ve çapraz özellik analizleri gibi ileri metodolojileri kullanmaktadır. Örneğin, araştırmalar akciğer ve gastrointestinal hastalıklar arasındaki ortak genetik mimariyi karakterize etmiş ve benzer büyük ölçekli ekzom dizileme popülasyonları akciğer kanseri ve ilişkili solunum hastalıklarının çapraz özellik çalışmalarında kullanılmıştır[6]. Daha ileri epidemiyolojik araştırmalar, pnömoni duyarlılığını etkileyen karmaşık genetik mimariyi ve bunun diğer durumlarla ilişkisini derinlemesine incelemektedir. Çalışmalar, müsin biyolojisini pnömoni duyarlılığında rol oynadığını göstermiş ve psikiyatrik hastalıklarla potansiyel bir ilişki tanımlamıştır. Genel pnömoninin ötesinde, pnömokoksik menenjit gibi belirli bakteriyel enfeksiyonlara odaklanan araştırmalar, genetik belirleyicileri ortaya çıkarmak için insan ve patojen genomlarının birlikte dizilenmesini kullanmıştır. HLA bölgesi ince haritalama çalışmaları da dahil olmak üzere bu kapsamlı yaklaşımlar, yalnızca pnömoni için değil, aynı zamanda diğer birçok yaygın enfeksiyon için de duyarlılık lokuslarını tanımlamakta ve konakçı genetik faktörlerine ilişkin içgörüler sunmaktadır[3].

Popülasyona Özgü Genetik Faktörler ve Farklı Soylardan Elde Edilen Bulgular

Section titled “Popülasyona Özgü Genetik Faktörler ve Farklı Soylardan Elde Edilen Bulgular”

Popülasyonlar arası karşılaştırmalar, farklı etnik ve coğrafi gruplar arasında bakteriyel pnömoni riskine katkıda bulunan çeşitli genetik ve çevresel faktörleri anlamak için çok önemlidir. Araştırmalar, belirli popülasyonlarda pnömoni duyarlılığı ile ilişkili spesifik genetik varyantları tanımlayarak soy farklılıklarını vurgulamıştır. Örneğin, β-globin lokusundaki varyantların Afro-Amerikan çocuklarda pnömoni ile ilişkili olduğu bulunmuş, bu da popülasyona özgü genetik etkilerin altını çizmektedir. Bu çalışmalar, genetik soy dağılımlarını dikkatle hesaba katarak, potansiyel karıştırıcı faktörleri düzeltmek için sıklıkla genetik ana bileşenler gibi yöntemler kullanır[2]. Belirli etnik grupların ötesinde, farklı popülasyonlar genelindeki araştırmalar, bulaşıcı hastalıklara karşı genetik direnç ve duyarlılığın daha geniş kalıplarını ortaya koymaktadır. Mycobacterium tuberculosisenfeksiyonuna odaklanırken, bir genom çapında ilişkilendirme çalışması, üç farklı popülasyonda 10q26.2’de bir lokus tanımlayarak, genetik faktörlerin farklı demografik gruplar arasında nasıl değişiklik gösterebileceğini veya korunabileceğini göstermiştir. Bu tür bulgular, hastalık yükündeki coğrafi varyasyonları anlamak ve hedefe yönelik halk sağlığı stratejileri geliştirmek için hayati öneme sahiptir; tanımlanan spesifik genetik lokuslar bir dizi bakteriyel enfeksiyonla ilişkili olabilse de[8].

Gelişmiş Metodolojiler ve Çalışma Sınırlamaları

Section titled “Gelişmiş Metodolojiler ve Çalışma Sınırlamaları”

Bakteriyel pnömoni üzerine yapılan popülasyon çalışmaları, genetik ve epidemiyolojik ilişkilendirmeleri belirlemek için büyük ölçekli kohort çalışmalarından genom çapında ilişkilendirme çalışmalarına (GWAS) ve meta-analizlere kadar çeşitli gelişmiş metodolojiler kullanır. Araştırmacılar, hastalık belirlemesi için tıbbi kayıt incelemeleri ve ICD-9 kodlarını kullanır; genellikle biyobanka çalışmalarından ve boylamsal bulgulardan yararlanarak sağlık sonuçlarını zaman içinde izler. İnsan ve patojen genomlarının eş zamanlı dizilemesi gibi gelişmiş teknikler, konak ve mikrop arasındaki karmaşık genetik etkileşimleri anlamak için uygulanır; pnömokok menenjiti ve diğer enfeksiyon hastalıkları üzerine yapılan çalışmalarda bunun örnekleri görülmektedir[2]. Sağlam tasarımlara rağmen, popülasyon çalışmaları sıklıkla temsil kabiliyetlerini ve genellenebilirliklerini etkileyen metodolojik sınırlamalarla karşılaşır. Çalışma katılımcılarının seçiminden, örneğin pediatrik vakalar için yetişkin kontrol grupları kullanmaktan kaynaklanan zorluklar ortaya çıkabilir; bu durum, hastalık prevalansının değerlendirilmesini ve genetik ilişkilendirmeleri saptama gücünü etkileyebilir. Etkilenen ve kontrol grupları arasındaki komorbid durumlardaki farklılıklar veya geçmiş hastalık teşhislerini belirlemedeki zorluklar da çalışma bulgularını etkileyebilir. Araştırmacılar, bu sorunları genellikle genetik soy dağılımlarını dikkatlice eşleştirerek ve ana bileşenler için düzeltmeler yaparak ele alırlar; bu tür faktörlerin popülasyon düzeyindeki çıkarımları yorumlamak için kritik öneme sahip olduğunu kabul ederler[2].

Bakteriyel Pnömoni Hakkında Sıkça Sorulan Sorular

Section titled “Bakteriyel Pnömoni Hakkında Sıkça Sorulan Sorular”

Bu sorular, güncel genetik araştırmalara dayanarak bakteriyel pnömoninin en önemli ve spesifik yönlerini ele almaktadır.


1. Ailem sık sık pnömoni oluyor. Ben de olur muyum?

Section titled “1. Ailem sık sık pnömoni oluyor. Ben de olur muyum?”

Evet, aile geçmişiniz rol oynayabilir. Genleriniz, bakteriyel pnömoniye karşı bireysel yatkınlığınızı etkiler. Yakın aile üyeleriniz sık sık bu hastalığa yakalanıyorsa, enfeksiyona karşı sizi daha savunmasız hale getiren bazı ortak genetik faktörlere sahip olabilirsiniz.

2. Pnömonim neden arkadaşımdan çok daha ağır geçmeme neden oldu?

Section titled “2. Pnömonim neden arkadaşımdan çok daha ağır geçmeme neden oldu?”

Genetik faktörler, bakteriyel pnömoniye ne kadar şiddetli tepki verdiğinizi büyük ölçüde etkileyebilir. Hem siz hem de arkadaşınız enfekte olsa da, taşıdığınız spesifik genetik varyantlar daha güçlü bir enflamatuar yanıta veya daha az etkili bir immün temizlenmeye yol açarak hastalığınızın daha şiddetli seyretmesine neden olabilir.

3. Arka planım zatürre riskimi etkiler mi?

Section titled “3. Arka planım zatürre riskimi etkiler mi?”

Evet, etkileyebilir. Araştırmalar, zatürre için genetik risk faktörlerinin farklı atasal gruplar arasında değişiklik gösterebileceğini göstermektedir. Örneğin, β-globin lokusundaki belirli gen varyantları, Afrika kökenli Amerikalı çocuklarda zatürre ile ilişkilendirilmiş olup, etnik kökenin yatkınlığı nasıl etkileyebileceğini vurgulamaktadır.

4. Sağlıklı yaşarsam, ailemin zatürre geçmişini yenebilir miyim?

Section titled “4. Sağlıklı yaşarsam, ailemin zatürre geçmişini yenebilir miyim?”

Sağlıklı bir yaşam tarzı her zaman faydalıdır ve genel riskinizi azaltmaya kesinlikle yardımcı olabilir. Genleriniz sizi zatürreye yatkın hale getirse de, kaderinizi tamamen belirlemezler. Aşılar ve iyi hijyen gibi hedeflenmiş önleme stratejileri, sağlıklı yaşamdan gelen güçlü bir bağışıklık sistemiyle birleştiğinde, genetik yatkınlıkları önemli ölçüde hafifletebilir.

5. DNA testi zatürre için yüksek risk altında olup olmadığımı söyleyebilir mi?

Section titled “5. DNA testi zatürre için yüksek risk altında olup olmadığımı söyleyebilir mi?”

Gelecekte, evet, mümkün. Bilim insanları, yeni tanı yöntemleri geliştirmek amacıyla genetik faktörleri aktif olarak araştırmaktadır. Genetik yatkınlıklarınızı anlamak, eninde sonunda daha yüksek risk altında olup olmadığınızı belirlemeye yardımcı olabilir ve bu da daha kişiselleştirilmiş önleme stratejilerine olanak tanıyabilir.

6. Yaşlandıkça genlerim beni daha savunmasız hale getirecek mi?

Section titled “6. Yaşlandıkça genlerim beni daha savunmasız hale getirecek mi?”

Yaş, pnömoni riskinde önemli bir faktördür ve genetik yatkınlıklarınız bunu artırabilir. Yaşlılar savunmasız bir popülasyondur ve genler yaşam boyunca bir rol oynasa da, bağışıklık sisteminiz yaşla birlikte doğal olarak değiştikçe duyarlılık üzerindeki etkileri daha belirgin hale gelebilir.

7. Zayıf bağışıklık sistemim genetik riskimi kötüleştirir mi?

Section titled “7. Zayıf bağışıklık sistemim genetik riskimi kötüleştirir mi?”

Kesinlikle. Bağışıklık sisteminiz, bakterilere karşı ilk savunma hattınızdır. Eğer zayıflamışsa, işgalci bakterilerin yerel savunmaları daha kolay aşmasına izin verir ve inflamatuar bir kaskadı tetikler. Bu durum, sahip olduğunuz altta yatan genetik yatkınlıkları daha da etkili hale getirerek, şiddetli zatürre riskinizi artırabilir.

8. Daha önce zatürre geçirdim. Genetik olarak tekrar yakalanma olasılığım daha mı yüksek?

Section titled “8. Daha önce zatürre geçirdim. Genetik olarak tekrar yakalanma olasılığım daha mı yüksek?”

Mümkün. Daha önce zatürre geçirdiyseniz, bu durum vücudunuzun enfeksiyona karşı daha duyarlı olabileceğini düşündürmektedir. Çevresel faktörler rol oynasa da, genetik yapınız bu tekrarlayan yatkınlığa katkıda bulunarak sizi gelecekteki epizodlara karşı daha yatkın hale getirebilir.

9. Bazen tam olarak ne tür bir pnömoniye sahip olduğumu bilmek neden zor olur?

Section titled “9. Bazen tam olarak ne tür bir pnömoniye sahip olduğumu bilmek neden zor olur?”

Pnömoninin tanısı tam olarak konulması zor olabilir çünkü birçok farklı faktörden kaynaklanan geniş kapsamlı bir durumdur. Doktorlar, hastanın bildirdiği semptomlar veya faturalandırma kodları gibi çeşitli yöntemlere başvurabilirler; ancak bunlar, enfeksiyonunuza neden olan spesifik bakteri türünü her zaman belirlemez. Bu “fenotipik heterojenite”, net bir tablo elde etmeyi zorlaştırabilir.

10. Aşılar dışında zatürre riskimi azaltmak için yapabileceğim başka bir şey var mı?

Section titled “10. Aşılar dışında zatürre riskimi azaltmak için yapabileceğim başka bir şey var mı?”

Kesinlikle. Yaygın patojenlere karşı aşılama dışında, iyi hijyen uygulamak bulaşmayı azaltmak için çok önemlidir. Ek olarak, sağlıklı bir yaşam tarzıyla desteklenen güçlü bir bağışıklık sistemi, vücudunuzun doğal savunmasına yardımcı olabilir. Genetik faktörler üzerine yapılan araştırmalar da bireysel risklere göre uyarlanmış yeni önleyici tedbirler geliştirmeyi hedeflemektedir.


Bu Sıkça Sorulan Sorular (SSS), güncel genetik araştırmalara dayanarak otomatik olarak oluşturulmuştur ve yeni bilgiler mevcut oldukça güncellenebilir.

Sorumluluk Reddi: Bu bilgiler yalnızca eğitim amaçlıdır ve profesyonel tıbbi tavsiye yerine kullanılmamalıdır. Kişiselleştirilmiş tıbbi rehberlik için daima bir sağlık uzmanına danışın.

[1] Tangden, T. et al. A genome-wide association study in a large community-based cohort identifies multiple loci associated with susceptibility to bacterial and viral infections. Sci Rep. 2022.

[2] Halligan, N. L. N., et al. “Variants in the β-globin Locus are Associated with Pneumonia in African American Children.” HGG Adv, 2025.

[3] Reay, W. R. et al. The genetic architecture of pneumonia susceptibility implicates mucin biology and a relationship with psychiatric illness. Nat Commun. 2022.

[4] Gelemanovic, A. et al. “Genome-Wide Meta-Analysis Identifies Multiple Novel Rare Variants to Predict Common Human Infectious Diseases Risk.” Int J Mol Sci, vol. 24, no. 7, 2023.

[5] Zecevic, M., et al. “Genome-Wide Association Study of COVID-19 Outcomes Reveals Novel Host Genetic Risk Loci in the Serbian Population.” Front Genet, vol. 13, 22 July 2022.

[6] You, D. et al. “A genome-wide cross-trait analysis characterizes the shared genetic architecture between lung and gastrointestinal diseases.” Nat Commun, 2025.

[7] Gilchrist, J., et al. “BIRC6 modifies risk of invasive bacterial infection in Kenyan children.”Elife, 2022.

[8] Quistrebert, J. et al. “Genome-wide association study of resistance to Mycobacterium tuberculosis infection identifies a locus at 10q26.2 in three distinct populations.”PLoS Genet, vol. 17, no. 3, 2021.

[9] Wang, J., et al. “Genome-wide association analysis identifies variation in vitamin D receptor and other host factors influencing the gut microbiota.”Nat Genet, 2016.

[10] Tian, C. et al. “Genome-wide association and HLA region fine-mapping studies identify susceptibility loci for multiple common infections.” Nat Commun, vol. 8, 2017.

[11] Hughes, D. A., et al. “Genome-wide associations of human gut microbiome variation and implications for causal inference analyses.”Nat Microbiol, 2020.